樹林車站

兩座島式月台，一座側式月台。
　　側式月台的第三月台已於2007年5月3日啓用，僅機動性使用，大多以終點列車停靠為主，偶爾會有始發列車臨時從此月台發車。
　　跨站式站房，購票及服務設施設在三樓大廳，與前後站均有連通。
　　前站有兩座樓梯，一座進站一座出站。
　　後站僅有一座樓梯，因為原後站出站樓梯，被徵用為第三月台樓梯使用。
　　月台
　　1 1A █西部幹線（下行待避） 往台中、高雄方向
　　█東部幹線直通（上行） 到達
　　2 1B █西部幹線（下行） 往台中、高雄方向
　　3 2A █西部幹線（上行） 往台北、基隆方向
　　4 2B █西部幹線（上行待避） 往台北、基隆方向
　　█東部幹線直通（下行） 往花蓮、台東、高雄（經南迴線）方向
　　█東部幹線直通（上行） 到達
　　5 █林口線（上下行） 調車
　　7 3 █東部幹線直通（上下行） 到達

現為一等站。
　　為東部幹線（宜蘭、花蓮及台東方向路線）對號列車的實際起點站及終點站。
　　東部幹線區間車主要始發站及終點站。
　　西部幹線主要停靠區間車、莒光號以及部分自強號列車。
　　鄰近設有樹林調車場並由本站管理，供東部幹線各級列車整備、發車使用。
　　通往樹林調車場的軌道為平行於縱貫線的第三線（小運轉線），不影響主線行車。
　　如果小運轉線或其前後的道岔有問題，列車可以臨時經由西正線進出調車場。
　　二樓設有7-11便利商店及樹林就業服務站。
　　本站開放使用悠遊卡、台灣通及遠通ETC卡付費。
　　有地下化之規劃。