極性表面積

在藥物化學的應用中，極性表面積是評價藥物在細胞內的可運輸性質的描述指標。這一參數的大小與藥物在人體內的小腸吸收量、Caco-2單層可透性及血腦屏障的穿透性有明顯關聯。

一例子是當一分子的極性表面積大於1.4平方納米時，其在細胞的穿透性就會變差。一種需穿越血腦屏障並作用於中樞神經系統的感受體上的藥物，其極性表面積就不能大於0.6平方納米。