楊鵬

教育經歷 ^[2] 

2006 南京大學 理學學士

2011 北京大學 理學博士

工作經歷 ^[2] 

2011-2012 北京生命科學研究所

2012-2013 美國霍華德休斯醫學研究所HHMI

2013-2017 美國國立衞生研究院NIH

2018-今 同濟大學生命科學與技術學院

研究生高級分子生物學

早期胚胎髮育中細胞全能性的建立始於母源物質的消除及合子基因組的激活（Zygotic Genome Activation, ZGA）。逆轉座子作為合子中最早激活、比例最大的轉錄本，在 ZGA 完成後以異染色質化方式被迅速失活，以保證細胞完成全能性向多能性的轉變及胚胎基因組的穩定。之前研究認為，鋅指蛋白在逆轉座子的轉錄調控中發揮重要作用。然而，作為哺乳動物中數目最大、進化速度最快的轉錄因子家族，鋅指蛋白在上述過程中的靶向調控位點、異染色質高級結構建立方式和生物學功能仍知之甚少。

佔據人類基因組40%序列的逆轉座子在過去很長時間內一直被認為是基因組中的“垃圾序列”(Junk DNA)。然而最近的研究發現，這些來源於逆轉錄病毒的逆轉座子不僅是基因組的重要組分，還可以通過不同方式對基因組產生重要影響。並且，在長期進化過程中，其與宿主基因組中的鋅指蛋白形成了快速的共進化關係，通過一系列大分子複合物精密調控其中的相互作用。然而逆轉座子如何被轉錄調控的分子機理，以及不同鋅指蛋白的生物學功能一直比較模糊。為此本實驗室有以下幾個方向：

1.鋅指蛋白下游逆轉座子靶向作用序列，及相互作用鋅指蛋白間的調控網絡

2.鋅指蛋白與印跡基因在胚胎髮育中的相互作用關係及分子調控機制

3.鋅指蛋白與 CTCF 協同作用對染色質三維結構的影響

以上引自同濟大學生命科學與技術學院網站 ^[1] 

Guo M, Zhang L, Zhou J, Bi Y, Xu J, Xu C, Kou X, Zhao Y, Li Y, Tu Z, Liu K, Lin J, Yang P*, Gao S*, Wang Y*. Procise temporal regulation of Dux is important for embryo development. Cell Res. 2019;DOI:10.1038/s41422-019-0238-4.[Epub ahead of print](*Corresponding Author)

Patel A*, Yang P*, Tinkham M, Sun M, Wang Y, Hoang D, Wolf G, Horton J, Zhang X, Macfarlan TS, Cheng X. DNA conformation induces adaptable binding by tandem zinc finger proteins. Cell 2018;173(1): 221-233 (*Equal Contribution)

Yang P, Wang Y, Hoang D, Tinkham M, Patel A, Sun M, Wolf G, Baker M, Lai N, Cheng X, Shen J, Macfarlan T. A placental growth factor is silenced in mouse embryos by the zinc finger protein ZFP568. Science 2017;356(6339): 757-759.

Yang P, Wang Y, Macfarlan T. The role of KRAB-ZFPs in retrotransposon repression and mammalian evolution. Trends in Genetics. 2017;33(11):871-881

Yang P, Wang Y, Chen J, Li H, Kang L, Zhang Y, Chen S, Zhu B, Gao S. Rcor2 is a Subunit of the LSD1 Complex that Regulates ES Cell Property and Substitutes for Sox2 in Reprogramming Somatic Cells to Pluripotency. Stem Cells 2011; 29(5):791-801.

Wang Y, Wu Q, Yang P, Wang C, Liu J, Ding W, Liu W, Bai Y, Yang Y, Wang H, Gao S, Wang X. LSD1 co-repressor Rcor2 orchestrates neurogenesis in the developing mouse brain. Nat Commun. 2016;7:10481

Wolf G, Yang P, Füchtbauer A, Füchtbauer E, Silva A, Park C, Wu W, Nielsen A, Pedersen F, Macfarlan TS. The KRAB zinc finger protein ZFP809 is required to initiate epigenetic silencing of endogenous retroviruses. Genes & Dev. 2015;29(5):538-54.

Yang P, Wu W, Macfarlan TS. Maternal histone variants and their chaperones promote paternal genome activation and boost somatic cell reprogramming. Bioessays. 2015;37(1):52-9.

以上引自Publons、Google Scholar和ORCID網站 ^[3-5]