柔佛王國

1511年，葡萄牙人佔領馬六甲（馬六甲圍城戰）。馬六甲王國蘇丹馬哈茂德·沙阿(？～1528)率領軍民，轉移至吧莪(麻坡屬下的一個小鎮)和柔佛等地，繼續抗擊葡萄牙的入侵。

1515年，馬哈茂德·沙阿親率24艘蘭查槳帆船與進入蘇門答臘島暹羅河河道的葡萄牙船隊交戰，敗績於暹羅河之戰。

1525年，馬六甲王朝殘部攻打投靠葡萄牙人的林加羣島，在林加羣島之戰被兩艘葡萄牙卡拉克帆船挫敗。

1526年，賓坦島之戰爆發，馬六甲王朝殘餘勢力丟失重要據點賓坦島（民丹島）。

1528年，阿拉烏德丁（穆扎法爾二世）繼承王位，繼續在柔佛一帶抵抗葡萄牙人。

1535年，馬六甲城的葡萄牙征服者在埃斯蒂沃-達-伽馬率領下，趁柔佛素丹國立足未穩，在勒班河之戰中通過一場艱苦的內河攻堅，摧毀了柔佛人的第一個新都——哥打丁宜地區的高城，但柔佛人及時轉移，葡萄牙人並未獲得多少戰果。

1536年阿拉烏德丁與葡萄牙人講和。不久阿拉烏德丁正式建立柔佛王國，選定舊柔佛為首都。

柔佛王國建立以後，一方面不斷地與蘇門答臘島上興起的亞齊王國交戰，另一方面又繼續與葡萄牙殖民者進行戰爭。這個戰爭歷史上稱為“三角交爭”，大約持續一個世紀。

1547年亞齊蘇丹阿拉烏丁派其王子對葡萄牙人發動強大進攻。為了避免亞齊王國過於坐大，柔佛王國不惜默許馬來亞西北部的名義附庸吉打蘇丹等土著勢力幫助世仇葡萄牙人打敗了深入玻璃河流域的亞齊人（亞齊攻打馬六甲之戰）。

1551年，柔佛王國聯合爪哇人攻打馬六甲，試圖收復舊都，失敗（馬六甲圍城戰）。

1564年亞齊蘇丹國蘇丹阿拉烏丁進攻柔佛王國，擄走蘇丹，摧毀柔佛城。

1568年，亞齊蘇丹國蘇丹阿拉烏丁進攻葡萄牙佔領的馬六甲，柔佛為了報仇再次幫助葡萄牙人（馬六甲圍城戰）。

1587年葡萄牙人攻佔舊柔佛（柔佛城之戰）。王國遷都至巴都沙哇。

17世紀初葉，荷蘭、英國勢力侵入馬來半島。

1606年，荷蘭人與柔佛王國聯合攻擊馬六甲，但荷蘭人戰敗於拉奇多角海戰，柔佛人也在陸戰中敗績。不過，這意味着荷蘭人與南洋本土勢力聯合的開始。

1603和1613年，亞齊蘇丹伊斯坎達爾·慕達曾兩次進犯巴都沙哇（巴都·沙哇爾之戰）。1629年 ，他進攻馬六甲，但為葡萄牙、柔佛和北大年的聯合艦隊所敗（亞齊攻打馬六甲之戰）。

17世紀中期，葡萄牙與荷蘭爭奪東南亞香料貿易的矛盾日益尖鋭,雙方為擴大各自勢力範圍展開激烈的鬥爭。荷蘭聯合柔佛王國，在1640-1641年的馬六甲戰役打敗葡萄牙在馬六甲的軍隊，清除了葡萄牙在馬來半島的侵略勢力。柔佛王國國勢一度轉強。1673年，柔佛王國遭受蘇門答臘島上的佔卑的入侵，從此國勢一蹶不振。1699年馬哈茂德蘇丹被人暗殺。至此，馬六甲王國的王統中絕。柔佛政權落入首相之手。他改稱號為阿布杜爾.者利·黎耶·沙阿（1699～1719在位）。是為柔佛的首相王朝。

柔佛王國在18世紀從未統一，並先後受到來自蘇門答臘的錫克人和來自望加錫的武吉斯人的入侵和控制。其間森美蘭又從柔佛王國脱離出來，吉打、吉蘭丹和丁家奴已在暹羅控制之下，成為其保護邦。1795年柔佛王國只剩下彭亨、柔佛、新加坡和廖內羣島。而這些領土都被劃入荷蘭的勢力範圍。1824年柔佛王國把新加坡割讓給英國。1885年英國與柔佛簽訂一項條約，承認摩哈拉惹為柔佛蘇丹，同意保護柔佛抵禦外來的攻擊。英國可以派遣代理官駐柔佛，控制其行政權。1910年，海峽殖民地總督派出一位代理官，總攬其行政。1914年，英國與柔佛修改1885年條約，將派駐柔佛的代理官改為駐紮官。依據此約，英國的殖民地政府可以委任英人為司法及其他官員。至此，柔佛的行政、司法、財政之實權，均為英國殖民者所控制。