本體工程

“本體工程旨在明確軟件應用程序中包含的知識，以及特定領域的企業和業務流程中的知識。本體工程為解決語義障礙帶來的互操作性問題提供了方向，即與業務術語和軟件類的定義相關的障礙。本體工程是一組與特定領域的本體開發相關的任務。 ”

可以通過向相應的資源（例如視頻文件）添加豐富的語義來自動處理軟件代理無法解釋的信息。表示知識域的正式概念化的方法之一是使用機器可解釋的本體，其在RDF，RDFS和OWL中提供或基於RDF，RDFS和OWL提供結構化數據。本體工程是這種本體的設計和創造，它不僅包含術語列表（受控詞彙表）;它們包含術語，斷言和關係公理，用於定義概念（類），個體和角色（屬性）（分別為TBox，ABox和RBox）。本體工程是一個相對較新的研究領域，涉及本體開發過程，本體生命週期，構建本體的方法和方法，以及支持它們的工具套件和語言。提供本體邏輯基礎的一種常用方法是將描述邏輯的公理形式化，然後可以將其轉換為RDF的任何序列化，例如RDF / XML或Turtle。除了描述邏輯公理之外，本體還可能包含SWRL規則。概念定義可以映射到RDF中的任何類型的資源或資源段，例如圖像，視頻和感興趣的區域，以註釋對象，人等，並將它們與跨知識庫，本體和相關資源相互鏈接。 LOD數據集。這些信息基於人類的經驗和知識，對於自動解釋複雜和模糊內容（例如多媒體資源的可視內容）的推動者而言是有價值的。基於本體的推理的應用領域包括但不限於信息檢索，自動場景解釋和知識發現。

本體語言是用於編碼本體的形式語言。本體有許多這樣的語言，包括專有語言和基於標準的語言：

通用邏輯是ISO標準24707，這是一系列本體語言的規範，可以準確地相互轉換。

Cyc項目有自己的本體語言CycL，基於一階謂詞演算和一些高階擴展。

Gellish語言包括其自身擴展的規則，因此將本體與本體語言集成在一起。

IDEF5是一種開發和維護可用，準確的域本體的軟件工程方法。

KIF是基於S表達式的一階邏輯的語法。

規則交換格式（RIF），F-Logic及其後繼者ObjectLogic結合了本體和規則。

OWL是一種用於製作本體語句的語言，作為RDF和RDFS的後續開發，以及早期的本體語言項目，包括OIL，DAML和DAML + OIL。 OWL旨在通過萬維網使用，其所有元素（類，屬性和個體）都被定義為RDF資源，並由URI標識。

OntoUML是用於指定參考本體的有根據的語言。

SHACL（RDF SHapes Constraints Language）是一種描述RDF數據結構的語言。它可以與RDFS和OWL一起使用，也可以獨立使用。

XBRL（可擴展商業報告語言）是一種表達業務語義的語法。

生命科學正在蓬勃發展，生物學家用它來理解他們的實驗。為了從實驗中推斷出正確的結論，本體必須針對它們所代表的知識庫進行最佳結構化。需要不斷更改本體的結構，以便它是底層域的準確表示。

最近，一種自動化方法被引入生命科學中的工程本體，例如Gene Ontology（GO）。是最成功和最廣泛使用的生物醫學本體之一。基於信息理論，它重構本體，使得級別代表概念的期望特異性。類似的信息理論方法也被用於基因本體的最佳劃分。鑑於此類工程算法的數學特性，這些優化可以自動化，以生成原則和可擴展的架構，以重構GO等本體 ^[1]  。

開放式生物醫學本體論（OBO）是美國國家生物醫學本體中心2006年的一項倡議，為各種本體倡議提供了一個共同的“代工廠”，其中包括：

通用模型生物項目（GMOD）

基因本體聯盟

序列本體

本體查找服務

植物本體聯盟

功能基因組學的標準和本體