探針

一小段單鏈DNA或者RNA片段（大約是20到500bp），用於檢測與其互補的核酸序列。雙鏈DNA加熱變性成為單鏈，隨後用放射性同位素（通常用磷-32）、熒光染料或者酶（如辣根過氧化物酶）標記成為探針。磷-32通常被摻入組成DNA的四種核苷酸之一的磷酸基團中，而熒光染料和酶與核酸序列以共價鍵相連。

當將探針與樣品雜交時，探針和與其互補的核酸（DNA或RNA）序列通過氫鍵緊密相連，隨後，未被雜交的多餘探針被洗去。最後，根據探針的標記物種類，可進行放射自顯影、熒光發光、酶聯化學發光等方法來判斷樣品中是否，或者何位置含有被測序列（即與探針互補的序列）。