徐筱傑

20世紀80年代初，徐筱傑教授開始從事蛋白質分子設計及計算機輔助藥物分子設計研究，在分子對接，結合自由能計算，三維構效關係，ADME預測等方面進行了系統的研究，發展及改進了一些計算方法。近年來主要從事中藥現代化研究，開發了包括中藥方劑，中藥植物及中藥成分三維結構數據庫的中藥信息化系統，開展了基於中藥信息系統的虛擬篩選，中藥成分在化學空間、配體-靶標空間的分佈，基於生物網絡的多靶向篩選，中藥活性成分的篩選、分離、鑑定一體化技術等方面的研究。

教學：主講研究生化學信息學課程

1．藥物設計方法及應用：

着重發展分子對接，結合自由能及溶劑化能的計算，二維及三維構效關係，ADME預測及有關並行計算等相關方法及技術。 中華化學競賽網

2．中醫藥信息系統：

構建及完善包括中藥方劑，藥用植物及中藥有效成分的三維結構的醫藥信息系統及相關應用軟件。

3．超分子及介觀體系的計算機模擬：

利用分子動力學及介觀動力學研究蛋白質、核酸等生物大分子及有機分子的聚集狀態，高分子體系的聚集狀態，介觀形貌及相分離。

4．基於中藥資源的新藥研製：

已建成包括藥物設計，靶酶製備及活性測定，活性追蹤中藥有效成分的分離純化，利用分子烙印及藥物抗體方法直接從中藥體系中提取有效成分的工作平台。正開展抗丙肝及抗腫瘤藥物方面的研究。

課題：承擔973及國家自然科學基金重大項目

1. Hou TJ,Guo SL,Xu XJ; Predictions of binding of a diverse set of molecular dynamics and combination of molecular Dynamics and continun solvent models. J. Phys. Chem. B 106(21): 5527-5535,2002.

2. Hou TJ, Zhang W,Xu XJ; Binding affinities for a series o-f selective inhibitors of gelatinase-A using molecular dynamics With a linear interaction energy approach.J. Phys. Chem. B 105(22):5304-5315,2001

3. Hou TJ, Xu XJ; A new molecular simulation software package – Peking University Drug Design System(PKUDDS) for Structure based Drug Design. J. Mol. Graph. Mod. 19(5): 455-465, 2001.

4. Hou TJ, An Y, Ru BG, Bi RC, Xu XJ; Cysteine independent polymerization of metallothioneins in Solution and in Crystal. Protein Science, 9(12), 2302-2312, 2000.

5. Xie JC, Zhu LL, Xu XJ; Affinitive Separation and On-line identification of antitumor components from Peganum Nigillastrum by coupling a chromatographic column of target analogue imprinted polymer with mass spectrometry. Anal. Chem. 74(10): 2352-2362, 2002.

6. Qiao XB, Hou TJ, Zhang W, Guo SL, Xu XJ; A 3D Structure Database of Components from Chinese Traditional Medicinal Herbs. J. Chem. Info. Comp. Sci. , 42(3):481-495,2002.

7. Xie JC, Zhu LL, Xu XJ; Direct Extraction of Specific Pharmacophoric Flavonuids from Gingko leaves using a molecularly imprinted polymer for quercetin. J. Chromatogr. A 934(1-2): 1-11, 2001.