境界線上的地平線

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　　聖譜歷1648年，在曾被稱為神州的土地・極東上空的航空都市艦武藏，是極東唯一的獨立領土。在武藏上的阿利亞達斯特教導院三年梅組學生們過着平淡的生活。在學校，他們所謂的“上課”是追趕跑跳碰，什麼招都行，什麼招都不奇怪。但是此時主角葵・託利卻不見蹤影。

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　　本多・正純，是個立志要當政治家的窮學生，她在快餓死路邊的關頭，被輕食店“青雷亭”裏工作的自動人偶P-01s救了起來。另一方面三年梅組，葵・託利提議要在深夜的教導院裏玩試膽大會。

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　　為了除掉深夜的幽靈，三年梅組全員採購必要的物品。而此時的託利，踏進了久違的後悔通道。另一方面，正純也來到了後悔通道，從父親正信以及他的朋友小西那，聽説了十年前發生的事情。

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　　酒井・忠次在三河與本多・忠勝以及榊原・康政再會，但松平四天王卻還是三缺一，原來井伊・直政遇上了公主隱。另一方面，在武藏的阿利亞達斯特教導院，正在舉行除靈儀式，卻被新名古屋城方向的不明光柱給打斷。這到底有什麼陰謀？

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　　原來煙火的真面目，是三河的君主松平・元信策劃的地脈爐暴走。而他的目的，就是藉由三河的毀滅，得到大罪武裝，發動世界大戰。為了阻止他的野心，聖連派出號稱"西國無雙"的立花・宗茂，然而阻擋立花面前的，是“東國無雙”本多・忠勝。

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　　在松平・元信的策劃下，地脈爐暴走導致了三河毀滅。於是元信的女兒，也是擁有三河君主繼承權的赫萊森・阿利亞達斯特被判自裁。而當三年梅組知道P-01s就是赫萊森時，班上同學開始討論要不要營救赫萊森。開始上課後，真喜子老師出的課題是《我希望能做的事》。

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　　武藏阿利亞達斯特教導院召開臨時學生總會，決定日後的方針。若是決定拯救赫萊森，恐怕無法避免與聖連的全面戰爭。而此時，正純、奈特與直政，決定以聖連的立場思考，希望能證明武藏擁有能夠對抗聖連的實力。

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　　聖連與武藏的第三戰是正純與託利的辯論大會。然而先攻的託利竟然提出了與武藏相悖的“不去營救赫萊森”言論，而代表聖連的正純，因為主張被搶先發表而混亂不已。此時的託利希望正純回答“營救赫萊森將會對武藏帶來什麼好處”，兩人的立場彷彿顛倒過來了。

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　　在伽利略闖入之下，正純與託利的比賽以平手收場，於是進行到了延長賽。而延長賽的內容，竟是與警護隊隊長本多・二代對戰。要是輸掉的話，託利等人就無法去營救赫萊森了。然而最後上前迎戰的是？

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　　臨時學生總會結束後，託利一行人決定前往營救赫萊森。他們的目標是赫萊森被監禁的審問艦，但K.P.A.意大利的戰士團卻不是那麼好對付的。另一方面，空中較量也越來越激烈，武藏面對迎面而來的航空用武神，只能派出？

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　　被三徵西班牙與K.P.A.意大利的混合戰士團包圍，武藏陷入了危機，但在直政與奈特的活躍下，戰況逐漸轉危為安，於是託利一行人得以再度前往審問艦。然而伽利略率領K.P.A.意大利的正規軍來襲，再加上教皇伊諾森的“淫蕩的御身”啓動，武藏再度面臨極為不利的戰況。

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　　二代雖然一度敗給立花・宗茂，但她回想起與父親修練的種種往事，於是重新起身迎戰宗茂。另一方面，託利抵達審問艦，終於再度見到了赫萊森，但赫萊森卻拒絕前來救她的託利，堅持自裁認為才是最好的解決辦法。

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　　託利辦理了赫萊森的入學手續後，便搭載輸送艦上離開了戰場。但K.P.A.意大利榮光丸為了阻止託利，向“武藏”發動了攻擊。在千鈞一髮之中，託利與赫萊森啓動了大罪武裝“悲嘆的怠惰”。