反向疫苗學

最早進行反向疫苗研究的是B型腦膜炎球菌（meningococcus B）。先用計算機分析B型腦膜炎球菌的基因組，找到600個潛在的疫苗候補，將其中350個在大腸桿菌中進行表達，然後將蛋白提純用於免疫小鼠，其中找到29個蛋白能誘導小鼠產生抗體，從而達到預防免疫的作用。

第一，便捷，整個過程從分析基因組序列開始，不需要培養微生物。第二，寬泛，基於將所有的蛋白質看做是潛在的具有免疫原性的思路，整個過程從芯片法分析基因組序列開始，適用於所有微生物所有微生物疫苗的研究。第三，安全，可以對一些危險的病原微生物進行操作，避免病原微生物的擴散。第四，病原在不同時期和環境表達的蛋白質抗原都會被分析用來作為候選抗原，即使在對微生物的致病機理和免疫應答瞭解不多的情況下也可運用。

不能用於非蛋白的疫苗研究，如某些糖類分子。