原位合成芯片

這種芯片的集成度較高，可達10萬~40萬點陣/平方釐米。但合成的寡核苷酸探針長度較短，一般為8~20個核苷酸殘基（nucleotide, nt），最長為50 nt。因此，對於一般長度的基因，需使用多個相互重疊的探針片段進行檢測，才能對基因進行準確地鑑定。雖然物理集成度高，但相對而言生物遺傳信息的集成度受到影響。