蒼生大醫

中平六年，西涼刺史董卓進入洛陽，廢少帝，立獻帝劉協，自稱太師，專擅朝政，曹操不滿董卓倒行逆施，懷揣王芸所贈七星寶刀，意欲借探望董卓之際，伺機刺殺董卓，不料卻被識破，情急之下，在手下掩護中騎馬出逃。譙郡百姓舉行頂拐比賽，相國侄子董驃胡攪蠻纏要進行頂拐，譙郡縣醫官胡半仙提出董家軍與百姓們來一場頂拐大賽，董驃被大栓頂倒在地，管家命人將大栓抓起來，華氏醫館第四代傳人華佗出手解救，華佗指出董驃腰部有傷，骨頭錯位，如不及時治療，將失去雙腿。華佗以放了大栓為條件為董驃治療，治療過程極為痛苦董驃惱怒欲打死華佗，卻發現腰被治好了。華佗纏着大栓要與其比賽頂拐，大栓迫於無奈答應，華佗可是，他輸了人卻很不甘心，這時，他從小指腹為婚的蕙娘過來想要將他勸回了家，可在半路上卻碰到明心，華佗看到明心眼前一亮，而明心和蕙娘卻為了華佗而爭吵了起來。此時董驃發現華佗與明心等人，他一眼就卻看上了明心，想要娶明心。惠娘答應華佗留下來，華佗與明心重返頂拐賽場，大栓調侃華佗與惠娘，明心吃醋要離開。而吳成，華佗的二師兄一直暗暗喜歡着蕙娘，他看到蕙娘沒有錢買頭花，就幫她買了下來，可是，蕙娘卻並沒有接受。華佗追上明心，假裝受傷引明心關懷，明心稱其父明日要坐堂迎親，華佗與明心打情罵俏並稱明日一定會演場好戲。華佗偷偷潛回家，被華父發現並向其丟人蔘，華父訓斥華佗，華佗又跑了出去找大師兄二師兄去喝酒。曹操逃回譙郡呂伯家並以實情相告，呂伯收留曹操，半夜被馬鳴驚醒。呂伯出門悄聲交代其子看好曹操，曹操起疑。牛二拜見縣令明心之父參加相親，狀況百出，縣衙內除了牛二再無別的男子來參加相親，原來是牛二的手下阻攔別的參加相親，華佗扮成天師自稱為牛二和明心合八字，混進縣衙內自稱為牛大，華佗奉承牛二並提出要先見明心，心花怒放的牛二果然答應了，華佗去見明心卻被明心認出，華佗耳語給明心自己的計策。喜蓮戴着面紗假扮明心見牛二，牛二欲摘下面紗被阻止，喜蓮在明心的指示下給牛二設置了三關，第一關測食量，在規定時間內喝完茶吃完蘿蔔，第二關測體力，在水流光之前拿到手絹，前兩關牛二均未完成，第三關測膽量，要求牛二將自己的面紗揭下，牛二滿心歡喜將面紗揭下，卻發現將自己畫的奇醜無比的喜蓮，奪路而逃撞上前來一看究竟的縣令，縣令澄清明心才是自己的女兒，牛二卻因為吃了太多蘿蔔和熱茶放屁不止，事已至此華佗即向縣令拜別，卻因鬍子沒有粘好而被識破。縣令訓斥明心被明心的奶奶阻止。明心跑出來見華佗，送給華佗一把壺希望能安定他的心神。兩人互訴衷情，約定一起漂泊天下，懸壺濟世。呂伯家人磨刀，曹操以為是要殺他，將其二人殺害，此時呂伯沽酒返回家中，曹操方知他們是要殺豬慰勞自己，曹操一不做二不休三拜於呂伯之後又將呂伯殺害，當空大喊：寧可我負天下人，不可天下人負我。卻不知草垛當中始終有一人偷偷在旁觀看。

華佗偷跑回家，吳成責備華佗，惠娘出來打圓場。此時官兵查封醫館，稱華父治死病人，原來是華父冒險用了一味麻醉藥藥，病人始終未醒，但華父堅持聲稱病人一定會醒來，縣令私下與華父達成協議華佗不再糾纏明心就幫助華父化解此事，華佗突至縣衙聲稱帶來解藥，半個時辰一定讓病人醒來，否則任憑處置。喂下藥丸後，吳成向胡半仙暗示去找明心，華佗捶打病人，眾人不解以為華佗對死者不敬，明心趕來解救。縣令命人華佗拉走，明心以持簪自殺要挾，慌亂中吳成挺身而出要求一試，不想病人卻轉而醒來，縣令無奈放了華氏父子。華父訓斥華佗不應與明心糾纏，華佗卻稱對惠娘只是姐弟之情，非明心不娶，不料惠娘卻在門後偷聽，傷心離去。明心對其父表明非華佗不嫁，縣令卻説早已將明心許配給董丞相侄子董驃，而且迎親的日子就是明天。華府上下欲喝酒慶祝吳成立下大功，華父卻將吳成帶走訓斥吳成喂病人服下的乃是九轉丹，因其藥性太猛，患者已經有輕微中毒跡象，差點釀成大錯，命其停止研製。吳成反駁，華佗出來打圓場，吳成不領情卻埋怨師父有私心不將研製麻醉藥的事情告訴自己。華佗主動退讓，吳成反而心生間隙。華父再次警告吳成再不許碰九轉丹。吳成自己在一旁暗自鬱悶，惠娘為其端飯吳成心生感動，並向惠娘吐露心聲，惠娘為華父辯解，吳成怨天不公平，剛想向惠娘表白，惠娘急匆匆地逃走了。明心向奶奶求救，無奈董驃看上明心卻無人敢得罪他。明心便向華佗傳信他明晨私奔，華佗找吳成要錢，吳成反而訓斥華佗不懂得珍惜惠娘，華佗執意要走，惠娘出現並表明願意讓華佗走，吳成卻不贊同，爭執之下，華父來到了解實情後，要打死華佗，惠娘擋在華佗身前替其擋了一棍。當夜華佗被強行抓起來與惠娘洞房，華佗反抗無效，華父命吳成守在洞房前，華佗提出與吳成交換出去見明心。明心欲帶喜蓮與胡半仙出逃，胡半仙膽小欲逃而被喜蓮威脅。此時華佗與吳成均在喝悶酒，吳成想起小時候惠娘對自己的好，房中惠娘阻攔華佗喝酒，華佗已然喝醉而將惠娘誤認為是明心與其圓房，吳成在門外心如刀絞。天亮吳成將門打開後黯然離去，而華佗與惠娘依然在房中熟睡。胡半仙以查看婚禮佈置為藉口將縣令騙到大門口，明心從後門偷偷出來上馬車逃走。迎親隊伍來到，縣令卻發現明心不見了慌忙尋找，明心到達約定地點卻不見華佗人影，翻牆進去發現華府喜聯高掛，敲門卻是惠娘來開門，明心發現華佗與惠娘圓房，傷心欲絕離開，華佗急忙去追明心。董驃在縣令府遲遲等不到明心出來，縣令找藉口拖延。曹操被人追殺，摔下馬背，為了躲避追殺，曹操殺了守城士兵，以一己之力想關上大門，華佗正追趕明心而來，為了阻止明心出城，而幫助曹操一起關上大門，亂箭射入城中，明心的馬車翻倒，華佗來不及救明心，惠娘趕來幫助華佗不料有一隻亂箭直直地射向惠娘，而她已躲避不及。

吳成突然一把拉過惠娘，明心正好探身過來看情況，這支原本會射中惠孃的箭一下子射中吳成，然後箭頭穿過吳成的身體正好再次射中他身後的明心。一支箭將兩人串在了一起。華佗眼睜睜地看着這突然發生的一切不知所措。幸好曹操的家兵正好趕到，一舉殲滅所有的追兵。眾人趕緊將吳成和明心送到縣令府中救治。董驃正在為明心逃婚的事威脅縣令。曹操如今回到譙郡縣，想壯大勢力，所以準備與縣令結盟。眾人都知道曹操刺殺董卓之事，董驃更是怕的躲了起來，完全沒有了剛剛趾高氣揚的架勢。他偷偷地溜了出去。曹操藉口要給縣令賀喜送賀禮，出去片刻後又返了回來，送上的賀禮竟然是殺了董驃的迎親隊伍和董驃的項上人頭。縣令和眾人皆愕然。縣令沒有退路只得與曹操結盟。華佗棄婚私奔讓華父暴跳如雷，他把家族的一些重要人物請來做見證，他要把華佗逐出家門。惠娘覺得事情皆因自己而起，於是哀求華父自己願意退婚成全華佗和明心，華父根本不答應。於是惠娘提出要隨華佗一起出家門，追隨他照顧他。華父見惠娘心意已決也只得隨她。華佗和惠娘在一處破廟安家。經過救治身體已無大礙的吳成隨後送來一些被褥。華佗與惠娘約好晚間分開而住，惠娘沒有提出異議。華佗一心要找明心解釋，明心嘴上怒氣未消，內心卻還惦記着被逐出家門的華佗是否安好。縣令要在譙郡縣招兵買馬擴充勢力。譙郡縣的精壯勞力都來參加驗兵。胡大仙是此次驗兵的體檢官，他藉着手中的權力想借此機會斂財。他的做法引起前來驗兵的大栓等勞力的不滿。華佗也來參加驗兵，胡半仙勸他回家，他作為華佗的大師兄知道華家就只有華佗一棵獨苗，師父是不會讓他去當兵的。於是華佗另立山頭，自己要成立一支隊伍，於是將大栓等人拉到自己麾下。曹操帶着自己的曹家軍來到招兵現場，讓他們演練給眾人看。曹軍的威武雄壯震撼了縣令和華佗。華佗更是將曹操當做心目中的英雄崇拜。

晚間有董卓的細作潛入譙郡縣令府，勸縣令不要與曹操合作，要看清形勢，不要與董太師的精兵強將以卵擊石。縣令很糾結，想到董驃之死董卓可能不會放過自己，於是提出要董卓的手諭，對董驃的死不予追究。細作滿心歡喜地回去覆命。細作行色匆匆路過一片墳場時正巧被醉酒睡在此處的華佗絆倒，華佗看到從他身上掉落的董軍的令牌，便知他是董卓的細作。華佗將他交給曹操。在細作離開後，縣令一直非常矛盾。明心這時幫父親分析形勢，讓父親分清利弊，着眼長遠，不要與董軍聯盟，與曹操共同抗董才是正道。縣令內心搖擺不定之時，曹操邀縣令一起查看練兵。當着眾軍曹操把細作抓到台前，要縣令弒細作壯軍威。面對曹操咄咄逼人的目光和眼前眾目睽睽的注視，縣令只得殺了細作。此舉徹底將縣令逼上與董軍對立的境地。明心一直擔心華佗的安危，自己又不好意思親自打探他的消息。於是讓父親請吳成給自己治傷，她不動聲色地向吳成打聽華佗的近況，也想給華佗一些幫助。吳成旁敲側擊地告訴她，華佗一切安好，讓明心不要打擾他和惠孃的生活。董卓的軍隊兵臨城下，形勢十分危急。曹操的軍隊、縣令的軍隊以及華佗招募的軍隊三方一起共抗董軍。華佗在作戰時穿梭于軍隊之中，忙着搶救傷員，在他眼裏只有傷員不分敵我。大栓對華佗迂腐的醫者之心無可奈何，作戰之時還要分暇照顧華佗。董軍來勢洶洶訓練有素，譙郡的軍隊最後雖然取得勝利但也損失較重。在眾人歡慶勝利的時候，縣令想到譙郡兵力有限沒有可補充的力量，而董軍的兵力卻可以源源不斷地增援。縣令憂心匆匆。

華佗一直見不到明心的面得不到她的原諒，便常常喝酒麻醉自己，聊解相思之苦。得知二師兄吳成正在為明心治傷，於是他將自己要對明心説的話都寫在信上，拖吳成帶給明心。吳成轉念一想答應下來，並告訴華佗如果明心不回信則表示不能原諒他，讓他從此死心好好與惠娘過日子。華佗將信交給吳成，興高采烈地走了。吳成轉身就把他的信扔了。董軍果然派來增援大肆進攻譙郡縣，縣令這次採取了坐山觀虎鬥的做法按兵不動。曹操帶軍與董軍浴血奮戰，無奈兵力懸殊很快曹操就傷痕累累，危在旦夕。明心看到這一切，勸在城牆上觀望的父親出兵救曹操。縣令還在猶豫，卻看到華佗帶着他的兵們用推車推着一車發出濃濃的黃煙的藥草衝入陣前。藥草發出刺鼻的氣味，眾軍士紛紛捂鼻。華佗乘亂救回曹操。曹操感恩華佗再次救得他的性命。戰事還在進行，傷員是越來越多。華父看到一向頑劣的華佗此時專心致志地救護傷員深感欣慰。明心藉故來看傷員，為傷員送來食物，看到忙碌的華佗內心竊喜，表面卻裝着冷冰冰的樣子。華佗一直沒有收到明心的回信，不知道她的真實想法心裏十分惶恐，卻一直沒有機會與她交流。大栓受了重傷從戰場上被抬了下來。看到大栓痛苦不堪的樣子，華佗無法想象像大栓這等鐵血男兒都緊皺眉頭，那該是怎樣的疼痛。再看旁邊另一個傷員，因為傷口很深無法處理，已經潰爛長了蛆蟲。華佗知道如果有麻醉藥物為他們止疼，只要進行一些小的手術他們的傷就不會這麼惡化。華佗很痛苦，於是他給自己灌了很多酒，然後讓惠娘在他醉的不省人事時用刀刺傷他，他想試試醉酒後能忍住多大的疼痛。

華佗眼看大栓等人受傷痛折磨，於是不計前嫌求父親將麻醉藥交給自己救人。華父告訴他麻藥目前還沒有研究成熟，極易出事。但橫豎都是會死，華佗還是想試試。哪知用過麻醉藥為大栓做完手術後，大栓竟然還是死亡。華佗用麻藥失敗痛失好友，內心深受打擊。華父見華佗用心從醫，於是將自己研究的麻醉藥的配方交給華佗，讓他繼續研究下去，將麻醉藥研製成功。縣令見曹操兵力有限，數次作戰已讓他元氣大傷，他自己還受傷一直靜養。而今，軍隊的糧食供給也已出現危機，於是他決定棄曹操投奔董卓。為瓦解曹操的兵力，他乘曹操受傷養息之際，先後説服曹操的副將夏侯勇等人，約定時間發動兵變，將曹操一舉拿下送給董卓，作為自己投誠董卓的誠意。由於大戰在即，而大將夏侯勇稱病不出。曹操疑心有異，於是讓華佗前去為他醫治。名為探病，實為探得他的虛實。華佗查出夏侯勇根本無病，夏侯勇擔心華佗的如實彙報會讓曹操心中生疑，而約定兵變的時間就在幾個時辰以後。縣令帶着胡半仙趕到夏侯勇府上，為堵住華佗之口，他們準備殺了華佗。胡半仙念在華佗是師父的獨苗，於是建議留下他的性命，因為他不回去覆命曹操照樣會生疑。如今兩全的辦法就是灌醉華佗，讓他回去後也開不了口。明心偷聽到父親與胡半仙的密謀，他們準備還是把華佗沉江滅口。她心急如焚，因為縣令下了她和胡半仙的禁足令，他們無法將消息傳出去。晚上明心在胡半仙的窗外放了一張供桌，説是要祭拜亡靈，還威脅下人們守口如瓶，然後藉口讓亡靈享用供品將桌子留在了窗外。胡半仙在屋裏聽到明心與下人們的對話後心領神會，他偷偷地從窗子溜了出去。胡半仙心急火燎地將從縣令那裏偷來的曹操副將們按了手印的投降書交給吳成，還把華佗的現狀和曹軍副將要兵變的事告訴了吳成，讓他趕緊去通報。他自己得乘看守房間的人未發現時趕緊回到房間。華佗喝的酩酊大醉不省人事。不久便有人架起他，將他拖上屋外的馬車。

夜半時分，惠娘在河邊洗衣服。離她不遠處一輛馬車停下後，有兩個人匆匆從車上將醉酒的華佗拖下來，扔進水裏後倉皇離開。一直緊隨的吳成看到他們離開後，趕緊將華佗從水中救起。華佗醒來後，吳成將胡半仙交給他的投降信遞給華佗，勸華佗安心從醫，不要過問戰事，再説如果曹操得知此事，必定要殺了縣令，到時候一定會傷了明心的心。華佗接過投降信想到一個萬全之策，然後趕緊去向曹操報信。吳成對華佗的想法不能理解。惠娘洗衣服時看到從上游飄來的華佗的木屐，她驚慌地順水流去尋，遇到吳成得知華佗安全後，緊繃的神經一下子鬆懈下來，人也暈了過去。吳成趕緊為她號脈，發現她懷孕了。曹操將一干欲謀反的副將們聚在一起。以夏侯勇為首的這些人惴惴不安。曹操原本暴跳如雷，可接受了華佗的建議後對這幹副將和顏悦色。曹操把他們按了手印的投降書拿出來給他們看，眾人大驚失色，手緩緩地握住了劍，準備與曹操拼個魚死網破。哪知曹操將降書付之一炬，眾人不解其意。曹操表示理解他們的想法，就以前對待他們的態度表示歉意，決定對他們的做法既往不咎。曹操這種恩威並施的做法既平息了兵變，又讓眾副將感恩戴德死心塌地。華佗連夜研製出一個奇異的木牀，用來對傷筋動骨的傷者矯正骨頭的位置。眾人對這奇異的木牀充滿好奇和懷疑的目光。曹操卻首當其衝願意一試。此木牀使用牽引配合按摩手法，果然有奇效。曹操久久難愈的錯位腿骨經此一試竟然能正常行走。這個發明對將來戰場上救治傷員起到事半功倍的效果。曹操大喜。董軍已圍困譙郡兩月有餘，如今軍中糧草供給十分緊張。縣令內心仍然左右搖擺不定。眼見董軍再次發起猛攻，曹軍因兵力懸殊已岌岌可危。董軍開始攻打城門，城門已抵禦不住被董軍擠開一條門縫，譙郡淪陷已在當下。華佗抱起一根粗大的樹幹準備抵住城門。惠娘也上前幫忙。明心見狀拿起鼓槌擂響戰鼓，譙郡肖縣民紛紛衝出家門，自發加入到抵住城門的隊伍，他們要誓死捍衞家園。

明心原諒了華佗，主動去破廟找他，兩人想重歸於好。華佗覺得終於守得雲開，內心非常激動，拉着明心的手憧憬着兩人美好的未來。惠娘看到這一切很失落。吳成卻替惠娘抱不平，痛斥華佗為了自己連孩子都不顧了。所有人都驚呆了。惠娘都不知道懷孕，華佗更沒想到新婚之夜自己酒醉後唯一的一次接觸竟然讓惠娘懷孕。明心徹底地心寒了，覺得和華佗再也沒有可能了。明心難過的心如刀割。因為譙郡被圍，城裏缺醫少藥，而惠孃的胎氣不穩需要安胎藥，吳成便向縣令提出放他出城採藥。縣令因為吳成是大夫出城採藥不會引起別人懷疑，所以説服了他替自己帶一封降書給董軍。吳成為了惠娘，加上縣令説投降是為了保護譙郡不受屠城，所以他答應下來。華佗也因為惠孃胎氣不穩想出城採藥，於是他跟隨吳成一起。吳成沒想到華佗會一起，為避開華佗將降書交給董軍，吳成故意引起董軍注意讓自己被董軍抓住，然後藉機將降書交給了董軍。逃脱的華佗卻為了吳成自投羅網，要求以自己的命換回師兄吳成的性命。吳成沒想到華佗如此仗義，內心非常愧疚。回到譙郡的吳成求縣令出兵救回華佗，縣令怕造成更大的傷亡，拒絕出兵。吳成還帶回董軍的話，要縣令拿出投降的誠意，若真心投降，讓他在晚上亥時將曹操抓住交給董軍，並大開城門迎接董軍以示誠意。縣令十分為難，抓住曹操幾乎是不可能的事。曹操得知華佗被抓的消息後，立即集合了軍隊要去救華佗，縣令勸阻他不要因個人的感情讓其他兄弟陪着去送命。曹操衝動地要孤身一人前去。正在此時，守軍通報華佗安然無恙地回來了。原來華佗借給守衞醫治腰痛病時動了手腳，不僅脱身還將降書也拿了回來。華佗把降書給曹操看，曹操很好奇自己對縣令嚴密監視下他是怎麼把降書傳給董軍的。華佗對縣令投降的做法很不齒。曹操卻告訴他自己也打算撤出譙郡，華佗很詫異，以為曹操輕易要放棄譙郡。曹操卻告訴他自己把縣令的一些軍士收歸自己麾下，他有萬全之策，可保譙郡百姓的安全。不過，他還需要華佗陪他在縣令面前演一場戲。

華佗把縣令手下的名叫單眼皮的士兵綁到縣令面前，謊説單眼皮拿着縣令的投降信勾結董軍，並把縣令寫的投降信出示給縣令看。縣令極力否認，明心更覺得華佗栽贓陷害。曹操帶兵包圍了縣令府，將縣令的家人及下人們通通抓了起來。胡半仙白天時拉着喜蓮準備逃走過他們的小日子，但喜蓮放不下明心堅持要回來。等他們回到縣令府才發現曹操的兵正在清查縣令府的人，要將他們全部抓獲。喜蓮以為明心會從側門逃走，於是到側門找明心，胡半仙只得跟着她。結果他們剛到縣令的書房，就被曹軍發現。拉扯中曹軍將喜蓮摔昏，胡半仙氣的將曹軍打暈後，拿着縣令書桌上的大印，扛着喜蓮就準備離城。守城衞士看到縣令大印打開了城門。一直守在城外等亥時縣令投降的董軍見城門大開，而胡半仙扛着一個裝着人的布袋走出城門，董軍以為是縣令投降的安排，大批人馬一擁而入，並搶過胡半仙扛着的喜蓮。曹操將縣令府所有人綁起來示眾，曹操告訴譙郡百姓，縣令想投降董軍將譙郡拱手讓給董軍。頓時人羣沸騰，百姓紛紛指責縣令。為了將戲份做的更足，曹操手起刀落刺死了單眼皮。華佗很震驚，質問曹操説好的不傷及性命為什麼不遵守諾言。曹操告訴他欲成大事不能拘於小節。明心的奶奶見曹操殺人又驚又怕，突發疾病撒手西去。這時有人驚呼董軍殺過來了。曹操不慌不忙地帶着曹軍從之前挖好的地道撤離到城外。曹操與華佗演的一齣戲就是要讓董軍認為譙郡縣令和百姓都是受他的脅迫才抗董，如此才能保全縣令及百姓的性命。一切都如他計劃的一樣。董軍並沒有為難譙郡。哪知半途突然出現一個人將譙郡又置於水火邊緣。原來此人就是當初陪董驃一起到縣令府迎親的家丁。他是當初曹操殺死董驃時唯一的活口。這些天來他一直裝成乞丐混跡在譙郡。他突然抓住董軍將軍的衣衫，急切地告訴他自己是董驃的家丁，是縣令和曹操勾結殺了董驃，這些天以來自己親眼目睹縣令與曹操勾肩搭背共同抵禦董軍。空氣突然凝結了，將軍眼中突現了殺氣。吳成給胡半仙眼神示意，讓他接近董驃家丁。胡半仙裝出仙姑上身的神神叨叨的樣子慢慢接近家丁，還説他得了失心瘋。將軍還未反應過來，吳成就悄悄的乘亂向家丁身上穴位紮了一針。家丁頓時出現失心瘋的症狀，將軍以為他真是失心瘋胡言亂語。眾人這才有驚無險地躲過一劫。但明心因為奶奶的突然去世和華佗一直針對父親，對他的誤會越來越深。華佗很難過，覺得與明心越走越遠。吳成看到惠娘在破廟艱難度日很是心疼，他將惠娘懷孕的事告訴了師父。華父很高興，親自接惠娘和華佗重返華府。

回到華府後的華佗專心醫術坐堂問診。為了研究針灸麻醉之術，他不惜先在自己身上做實驗。這天牛二來看病，華佗第一次用針灸麻醉為他醫治，果然有效，牛二很滿意，華佗卻劫富濟貧收他高額的診金。在為窮人看病時，華佗很好奇他們在戰後領取撫卹金的情況下還過得如此潦倒。結果眾人告訴他，他們戰後根本沒有從縣衙領到撫卹金。華佗為他們打抱不平，認為是縣衙將撫卹金貪污，於是將自己雙手綁起來，帶領眾人到縣衙請願。明心和吳成等人正憂心縣令的病情。縣令因胸口積着的淤血不能出去，整日咳嗽吐血已病的卧牀不起。華父和吳成對他的病也束手無策。明心看着父親病的奄奄一息憂心忡忡。耳聽華佗帶着眾人擊鼓鳴冤，父親明明將撫卹金髮放下去了可華佗卻污衊父親貪污撫卹金，明心認為一定是華佗看自己不理他故意打擊報復。華父聽説華佗帶人到縣衙請願，大罵他無事生非，於是留下惠娘在家，自己帶着下人們去縣衙勸回華佗。華佗見到縣令後，看他病入膏肓，於是主動上前為他把脈。哪知把完脈後華佗突然指着縣令破口大罵，眾人趕緊制止，誰料他越罵越兇，越罵越難聽，縣令氣的急火攻心將胸口積壓的淤血全部吐了出來。原來華佗劍走偏鋒用這種方法幫縣令除淤血。明心以為華佗要氣死父親，急的不知如何是好。縣令吐了血就昏了過去。突然有人來報，説是惠娘摔倒流了好多血。吳成聽後第一個衝了出去。華佗卻被明心死死攔住，要他等父親醒來確認無事才行。原來惠娘在家時見突然下暴雨，而屋外還曬着華佗的草藥。她冒雨幫華佗收草藥結果滑倒導致出血。吳成趕到華府後將惠娘從地上抱進屋內，看到她大出血吳成非常內疚。他告訴惠娘自己在她的安胎藥裏偷偷地放了小劑量的墮胎藥，她這次流產皆因自己不想讓她和華佗的孩子出生，因為華佗根本就不愛她。惠娘沒有責怪他，只求他以後不要再害華佗。吳成見惠娘危在旦夕心裏還想着華佗，他感到深深的絕望和不服，自己在惠娘心裏一點位置也沒有。等華佗回來，惠娘已生命垂危。華佗知道已無力迴天，只能緊緊地抱着她。惠娘在生命的最後時光，只希望聽到華佗能叫她一聲媳婦。聽到華佗叫她媳婦，惠娘知足地閉上了眼睛。

胡半仙又讓喜蓮隨他離開，還説要讓她過上好日子。喜蓮故意激將他憑什麼能給自己幸福生活，胡半仙得意地出示自己包裹裏大量的銀錠。喜蓮大驚，經過盤問才知道他竟然貪污了撫卹金。縣令大怒，將胡半仙驅逐出縣衙。胡半仙對喜蓮一往情深，不願遠離，於是在譙郡留下來以算命打卦為生。惠娘意外去世後，華佗抱着她的屍體站在縣衙外，稱惠娘之死皆因明心阻攔他回家貽誤了救治。明心也很內疚，於是親自送輓聯到華府祭拜惠娘，卻被華佗不領情地將輓聯扔在地上。明心遭此羞辱，當場説出從此以後與華佗恩斷義絕。惠孃的死讓華佗非常內疚，覺得對不起惠娘。他將自己親手為孩子做的小核桃手鍊放在惠娘墳前後黯然離開。吳成看華佗離開，偷偷地到墳前祭拜惠娘，他因為自己害死惠娘內心的罪惡感無法排遣，而轉念將一切的過錯都歸於華佗和明心，他要得到華佗得不到的。於是他開始別有用心地接近明心。華佗有一日在街上看到一個約摸三四歲的小孩，他手裏竟拿着從惠娘墳前拾到的小核桃手鍊。孩子看到華佗竟自然而然地生出親切感，他親暱地依偎在華佗懷中。華佗覺得這是惠娘怕自己孤單特意為自己找來的伴，這一切如天意一般。華佗收養了這個孩子併為他起名天來。轉眼幾年過去了。譙郡一直安寧祥和，而其他地方卻戰火連天，各路諸侯紛紛征戰。如今的曹操已位及丞相，卻挾天子以令諸侯。這一日，天來在街上和幾個小孩爭論當今世上劉備、關羽和曹操等人誰是真正的大英雄，華佗路過，孩子們纏着他問他過去與曹操交往的事。華佗不願多説，數落了天來幾句，天來生氣的把腿就跑。華佗趕緊追趕解釋，吳成正好遇到滿街尋找孩子的華佗。吳成告訴他現在正在招考太醫，譙郡有一個名額，他想和華佗一起去考。華佗卻滿足於現在與世無爭的生活，不想涉足官場，於是拒絕了吳成的邀請，讓他一個人去考。吳成轉身又去縣令府找明心。經過幾年的接觸和吳成別有用心地接近，明心已對吳成有了好感。她繡着鴛鴦，臉上滿是懷春少女的幸福和甜蜜。吳成來看她，告訴她自己準備參加太醫招考的事。明心替他感到高興，卻無意中眼前一黑，有一瞬間失去光明。這種症狀已出現好幾年，只是近些日子發作的比較頻繁。明心有些擔憂了。

喜蓮和明心都好奇明心到底生了什麼病，以致眼前老是發黑。吳成勸她好好修養。説到考太醫院的事，喜蓮勸吳成積極參考，因為縣令雖然知道吳成與明心這幾年日久生情情投意合，但總嫌他是個方外之士。如果他能進太醫院，縣令一定會答應將明心許配給他。吳成也覺得如今曹操要肅清董卓在太醫院的勢力，太醫院要大換血，所以空出很多職位，這才全國招考，這是個千載難逢的機會。喜蓮為明心熬的藥好了，她要去端來給明心喝。而吳成跟以往一樣堅持要自己去端。吳成去後，喜蓮將她的疑惑告訴明心，這些年來喜蓮老是發現吳成搶着去端藥，而且好幾次發現他往湯藥里加一種藥粉。明心讓她不要疑神疑鬼。喜蓮去廚房想幫吳成，結果發現他正在搗藥，然後將搗好的藥粉加入明心的湯藥碗裏。看到喜蓮過來他神色慌張地失手掉落了一顆藥丸。喜蓮疑竇頓生。吳成將湯藥端給明心後，匆匆嚮明心告辭離開。喜蓮卻發現他竟然又回到了廚房，似乎在地上尋找什麼東西。看到喜蓮他只得匆忙離開。喜蓮更加懷疑，也在地上尋找起來。結果找到一顆藥丸。喜蓮拿着藥丸去街上的卦攤找到胡半仙，胡半仙認出這是吳成研製的九轉丹。師父曾説過九轉丹技術不成熟，含有毒性，禁止吳成使用，沒想到他竟然給明心用。胡半仙心中有了主意，決定以此要挾吳成。胡半仙覺得譙郡最有競爭實力的就只有他們師兄弟三人。華佗不參賽，就剩他和吳成。而這次參選太醫是他唯一的翻身之機。於是他拿着九轉丹脅迫吳成退出遴選。吳成知道他如果退選明心一定會幫他，於是他答應了胡半仙。果然，當明心聽説吳成是放不下自己的病情捨不得離開自己才退選，內心非常感動，哭着讓縣令保留吳成參選資格。縣令於是力勸吳成不要放棄遴選，自己還希望他能當上太醫，謀得一官半職，只有這樣自己才會答應將明心許配給他。吳成暗自得意，裝出千恩萬謝的樣子應允下來。吳成將多年積蓄交給胡半仙，讓他就此隱瞞下九轉丹的事。至於參加太醫院考試的事，因為縣令和明心堅持，自己也沒有辦法退出。胡半仙氣急敗壞，看到吳成似乎無所畏懼毫不退縮的樣子，胡半仙氣的決定向明心揭發九轉丹的事。翌日，胡半仙偷偷溜進縣衙找到喜蓮，告訴她自己有重大事情要告訴明心。

喜蓮把胡半仙帶到後花園找明心，看到吳成與明心在花園恩恩愛愛的樣子，喜蓮非常羨慕，希望明心永遠這樣幸福下去，並説如果有人破壞明心的幸福，自己一定不得輕饒他。喜蓮的話讓胡半仙到嘴邊的話又咽了下去。但他還是不服，於是找到讓華佗來做這個惡人。華佗得知九轉丹的事果然非常氣憤，他勸吳成不要一錯再錯，要有醫生對待病人的責任心，而不是一味地想着自己的功名利祿。吳成沒有反思自己的過錯，反而以小人之心度君子之腹地認為華佗在遴選太醫的非常時期提九轉丹的事，就是想讓他不能順利參選太醫，一定是華佗起心想參選，藉此除掉他這個強有力的競爭對手。華佗覺得吳成執迷不悟，反而擔心他這種心術不正的人如果真進了太醫院將來會害多少人。於是華佗決定參加遴選，讓吳成這種人沒機會害人。參加遴選的大夫們彙集在集市上支起了問診攤，以此展示各自的醫術。華佗和吳成的診台前都拍起了長隊，胡半仙的診台無人問津。這時牛二因為扭傷了腰被家丁們扶着過來了。他把華佗診台前正在看病的李三驅趕過去，然後得意地扔出一袋錢給華佗，讓他給自己先看病。華佗收下他的錢袋，一股腦全倒在地上，牛二趕緊蹲下去一枚一枚地拾起來。華佗又對李三耳語一番，李三於是在華佗暗示的牛二的背上踢了一腳。牛二勃然大怒，正要發火，華佗卻告訴他，他的腰傷好了。牛二扭扭腰感覺腰果然好了。華佗告訴他讓他拾地上的錢是幫他先活動身體，讓李三踢他是幫他正骨。華佗不同尋常的治病方式引得圍觀百姓紛紛稱讚，也引起了圍觀人羣中太醫官甄太醫的注意。次日，甄太醫在縣令陪同下再次到問診處查看。看到華佗正用針灸的方式為要做小手術的病人麻醉，果然病人感到的是還能忍受的疼痛，華佗順利為病人做了小手術。華佗的這個麻醉術引起甄太醫極大的興趣，卻也讓吳成和胡半仙感到更大的威脅。於是吳成給胡半仙出了一計，讓他算計華佗讓他當中出醜。翌日，胡半仙給一個健康的小夥子一枚銀錠作為演出費，讓他故意裝出摔倒的樣子讓華佗醫治，然後戳穿華佗的醫術。果然，華佗開後，小夥子突然摔倒，裝出痛苦的樣子，華佗趕緊為他號脈檢查，發現小夥子懷裏的銀錠咯傷了他的脾臟，結果華佗深感遺憾地説小夥子危在旦夕，因為他的脾臟受了重傷。小夥子得意地告訴華佗自己沒病，只是被人請來演戲的。華佗讓眾人把他抬到醫館由華父診斷，果然小夥子開始吐血，如華佗所説命不久矣。胡半仙嚇壞了，找吳成出主意。吳成卻突然換做自己一無所有與自己無關的樣子，然後遞給他一串銅錢讓他離開逃走。胡半仙見吳成推得乾乾淨淨頓時傻眼了。

太醫院遴選工作第一輪實踐比試已經結束，甄太醫公佈的名單中華佗位列第一，吳成第二。吳成裝着不經意的樣子故意透漏給明心，還裝出一副不在乎仕途只為不能娶到明心的無奈。於是明心找到華佗，希望他退出遴選成全吳成。華佗告訴她自己不為名利，只因吳成心術不正。明心惱怒，覺得華佗還在打擊報復。華佗不得已將吳成給明心用九轉丹導致其眼疾告訴了她。明心不相信，她希望華佗不要誣陷吳成，成全她和吳成的婚姻。華佗見説服不了明心，只得答應了她。吳成如願考入太醫院。臨走時將為明心治病的事交給了華佗。吳成走後不久，明心眼疾再次發作。華佗沒有能力醫治，於是帶着明心準備去京城太醫院。途中，他們偶然救了被官兵追趕的一對母子，得知前方鎮子裏的守衞將軍夫人身染重疾，鎮上來的天師説是夫人染了邪祟，要用童男童女祭祀。華佗趕緊趕過去，想救下這些孩子。明心見華佗穿着木屐腳都磨爛了，於是把她為吳成做的新鞋子給了華佗一雙，讓他穿上新鞋去見將軍。華佗穿着這喜鵲登梅圖案的新鞋心裏美滋滋的。哪知剛出門就被士兵抓了起來。原來天師抓了童男童女後，説再抓一個穿喜鵲登梅鞋的人就夠了。華佗正好就撞上了。將軍把華佗和童男童女們抓到廣場，要拿他們祭祀。將軍夫人聞訊拖着病體趕了過來，讓將軍放了抓到的這些人。將軍夫妻情深，擔心夫人果真中了邪祟離開自己。華佗提出要見一見天師。結果一見之下，竟然是胡半仙。一切真相大白，知道所謂的邪祟皆是胡半仙在坑蒙拐騙。華佗親自為夫人看病，仔細檢查過後，華佗查出夫人腹中有死胎，所以才一直腹痛難忍。將軍大怒，説自己在外征戰兩年未歸，夫人何來懷孕一説。華佗讓將軍稍安勿躁，待他醫治後看結果再説。華佗為夫人針灸，不久後夫人果然產下死胎。將軍勃然大怒，以為夫人揹着自己與他人有染。華佗解釋説夫人一年前曾經流產，當時是雙胞胎，但只流下一個，另一個死胎一直在夫人腹中，所以她才會一直腹痛難忍。將軍夫婦澄清了誤會，又治癒了頑疾，對華佗感激不盡。

華佗一行人終於到了京城，京城果然熱鬧非凡。明心和天來興奮地在集市上東瞅西望目不暇接。天來看到小攤上售賣的彈弓很是喜歡，但華佗卻覺得彈弓不安全容易傷人。天來戀戀不捨，明心誠心要與華佗作對，堅持把攤位上所有的彈弓買下來送給了天來。天來很高興，華佗卻氣急敗壞，責怪明心不該慣着天來。結果轉眼之間天來用彈弓射中路旁拴着的馬匹，馬吃痛受驚狂躁地掙脱繮繩，撞倒了天來後還要狂奔。華佗想辦法制服馬匹後趕緊查看天來的傷情。有兩個人惡狠狠地過來責怪他們驚擾馬匹，華佗非常憤怒他們把馬匹看的比人還要重要。這時一個紅臉大漢上前向華佗道歉，華佗以為他是那兩個惡人的主人，對他也沒有好感，氣呼呼地離開了。哪知次日紅臉大漢找到華佗的住處，真心誠意地送來診金還要送天來去太醫院診治。一來二去後兩人相談甚歡，意趣相投，華佗得知他竟然是桃園三結義的關羽頓生敬意。關羽也對華佗的一些看法和為人甚是欣賞，兩人頓感相見恨晚結為好友。吳成把明心帶到集市上想給她買最出名的包子鋪的包子。結果被一個胖妹強行搶下鋪子裏所有的包子。胖妹趾高氣揚仗勢欺人，吳成不想惹事準備隱忍，喜蓮卻脾氣火爆不依不饒。胖妹本想發火，可一看到一表人才的吳成頓時裝出一副温柔靦腆的樣子。從集市回來後，胖妹便對吳成念念不忘。原來胖妹是太醫院甄太醫的妹妹甄依柳，因為父母雙亡，甄太醫對這個妹妹嬌縱寵溺，以致她刁蠻任性飛揚跋扈。吳成次日離家準備去太醫院時，甄依柳竟然守在門外給他送來了包子。吳成看到她碩大的比自己身體都寬兩個的身軀，趕緊避而遠之。甄依柳卻看中了他。等吳成傍晚從太醫院回來時，甄依柳竟然又守在他家門外，極力表達對他的好感。吳成想到白天太醫院討論到的甄太醫的妹妹，説是她一邊暴食一邊讓他們研究減肥藥方。聯想到眼前這位，吳成便向她打聽姓名。甄依柳轉念一想，故意説自己姓陳。吳成好不容易擺脱了甄依柳的糾纏進了家門，華佗問他什麼時候到太醫院為明心看眼疾，吳成又推三阻四找藉口。華佗卻心急的要自己帶明心去太醫院。明心看到吳成的態度很不開心。

明心的眼疾越來越嚴重，這一天她又再次短暫失明。華佗已忍無可忍，迫不及待地親自帶明心到了太醫院。他正在打聽吳成時，突然看到門口劉太醫將吳成開的藥方扔在地上，然後把他貶低的一文不值。華佗眼見吳成受這樣的窩囊氣義憤填膺，氣沖沖地與劉太醫理論。劉太醫根本看不起他。這時江大人行色匆匆地走進太醫院找賈太醫，竊竊私語地請賈太醫看病。賈太醫為難地告訴他自己專攻的是眼科，對他的病不會治。華佗衝進來不動聲色地為江大人號脈，説自己有辦法幫他治腎虛。華佗一下子説準了他的病症，江大人愣住了。華佗不由分説地取出針為他針灸，等江大人反應過來，華佗已為他針灸完畢。江大人頓感神清氣爽，華佗讓他回家試試看是否有效。華佗立竿見影的治療腎虛讓太醫院等人有些刮目相看。但賈太醫卻怕得罪劉太醫等人。所以推説自己不是唯一的看眼疾的太醫，讓華佗找其他人。正爭執間，甄依柳來到太醫院找吳成。吳成不勝其煩，告訴她自己有心上人，不喜歡她這種碩大體型的人。甄依柳還要糾纏，華佗忍不住對她的體型直言不諱，甄依柳這下子不依不饒地大吵大鬧，引來了太醫院醫丞甄太醫。甄依柳看到甄太醫鬧得更加歡騰，吳成這才知道胖妹原來是甄太醫的妹妹，這下他算是把甄太醫徹底得罪了。吳成小心翼翼地到甄太醫家裏求得他的原諒。甄太醫卻要華佗來認錯，還讓華佗交出麻醉藥的藥方，不然就不讓他們再在太醫院出現，更不要説幫明心看眼疾。華佗看甄太醫醉翁之意不在酒，非常氣憤。他決定乾脆去找曹操解決。江大人表情尷尬地被夫人拉到太醫院。夫人責怪太醫院的不該沒治好江大人的病，還讓他似乎更加嚴重了。為了下半生的幸福，她要求太醫院治好江大人的腎虛之疾。

江大人的夫人在太醫院大吵大鬧，吳成提出幫江大人針灸治療。江大人對吳成的醫術持懷疑態度，眾太醫也讓他不要逞能。吳成覺得這是自己難得的表現機會，再加上他也對針灸治腎虛比較有把握，於是他放出狠話，若治不好自己從太醫院引咎辭職。眾太醫抱着將信將疑的態度看他為江大人醫治。果然，三針下去，江大人稱有感覺，似乎好了很多，然後江夫人喜滋滋地和江大人回家了。曹操府裏的侍衞突然到太醫院傳令，讓所有太醫到丞相府為曹操治療頭疾。曹操的頭疾是老毛病，久治不愈，發作起來頭痛欲裂。眾太醫慌忙趕去，吳成正準備隨同一起，卻被甄太醫呵斥，讓他留在太醫院打掃衞生。吳成很失落，越發感到自己在太醫院不得志。眾太醫為曹操拿出了很多藥方，但都不能標本兼治，惹的曹操大發雷霆。華佗在居所突然被丞相府侍衞傳令，讓他去給曹操治病。原來因為江大人在曹操召集眾官員時缺席，曹操問及江大人時才從別的官員口中得知華佗大鬧太醫院的事，也才知道華佗在京。華佗到了丞相府看到兩側眾太醫神色凝重小心翼翼。華佗卻大呼小叫放浪不羈，看到曹操更是直呼其名毫不拘謹。曹操也知道這昔日老友的脾性，不與之計較。華佗看到眾太醫為曹操開出的藥方，一個個否認後扔在地上，引得眾太醫敢怒不敢言。華佗用針灸麻醉之術為曹操治頭痛，幾針過後疼痛立解。曹操大喜，要親自送華佗回居所，準備與他把酒言歡。吳成看到華佗帶回來的竟然是當今丞相，十分驚詫。曹操對他卻視而不見，讓他為自己和華佗喝酒時添酒加菜。吳成不敢反駁，卻暗自惱怒。華佗將天來介紹給曹操看，天來看到曹操認出他竟然是殺死家人的兇手。原來天來是吳伯的孫子，當初曹操誤殺吳伯一家時，天來躲在草垛裏逃過了一劫。但卻因為受了驚嚇再也説不出話。天來看到曹操十分驚恐，排斥曹操拉他的手。華佗和曹操都以為他是怕生。曹操走後，明心隔着窗看到吳成一副失落不得志的頹喪樣子。雖然華佗向他道歉，還答應將麻醉針法教會他，讓他以後給曹操看病謀取一個向上發展的前途，吳成還是很生氣，覺得華佗來後給他惹了不少事也出了好多風頭。晚上明心隔着門與屋內的華佗談心。她怕自己面對華佗時説不出口。她告訴華佗雖然兩人分開七年了，自己在心裏不斷提醒是華佗害死了她奶奶，可她就是放不下華佗，不能忘記他。她希望華佗第二天就回譙郡，她不希望華佗影響她好不容易接受的吳成。她問華佗是不是忘了她，華佗為了不讓她徒增煩惱，違心地説自己已經忘了過去的事。明心聽了這話徹底失望了。她難過地回到房裏。

吳成心中鬱悶，在酒館拼命喝酒，他恨華佗出盡風頭，他怨自己受到排擠。心胸狹窄偏執的他把這一切都怪罪於華佗身上，對華佗是恨之入骨。次日清晨等他回到家中，明心告訴他華佗已經走了，準備回譙郡。吳成想到華佗曾答應要教他麻醉之術，他也只有可能借掌握這個獨一無二的技能才可能在太醫院站住腳。他趕緊把華佗追了回來。華佗因為與曹操的關係，如今在太醫院可以自由出入，曹操還命太醫院從人力和物資上全力配合華佗。華佗卻直言不諱地説自己只想請賈太醫治眼疾。劉太醫聽説後主動請纓，華佗不知道劉太醫的醫術如何，不敢冒然為明心換醫生。賈太醫卻是個膽小怕事的人，他趕緊出來打圓場，偷偷跟華佗説等劉太醫為明心診治完了自己再偷偷來診斷一次。華佗這才鬆口請劉太醫為明心治眼睛。劉太醫果然是從太醫院出來的，他為明心檢查後指出明心繫中毒所致。華佗頓時對劉太醫刮目相看，才相信劉太醫果然有點本事。華佗虛心地將自己開的排毒的藥方向劉太醫請教，劉太醫指出將其中的兩味藥換成另外兩味，效果肯定不一般。劉太醫專業的建議讓華佗佩服的五體投地。華佗用他找人打造的各種手術刀第一次為關羽的戰馬做手術。手術的成功讓關羽歎為觀止。曹操這時命人將從呂布那裏奪回的赤兔馬送給關羽，關羽對赤兔馬喜愛有加，但他還是拒絕了。雖然劉備生死不明，但他還是一心只想輔佐劉備。關羽對結義兄弟的這種大義，讓華佗心生敬意。劉太醫很盡職地為明心治眼疾，把他研究的治療藥方給華佗看。華佗很感激他也非常信任他。因為華佗還約了賈太醫，於是華佗放心地讓劉太醫留在他的房間，自己出去見賈太醫。沒想到華佗前腳離開，劉太醫就在華佗用的針灸針上做文章，他偷偷地往上面下毒。原來劉太醫對漢朝死忠，夢想着有一天重振漢室，他按照大哥的命令和他的一干弟兄一起商量了下毒，所以他才千方百計接觸華佗。甄依柳依然肥胖，依然纏着吳成不放，但她實在是減不下來。她到吳成家裏一哭二鬧三上吊，卻始終打動不了吳成的心。於是她反其道而行之，另想了一計。既然吳成喜歡明心那種瘦子，而自己減不下來，那不如把明心變成胖子。於是她假惺惺地認明心為姐姐，給她送各種食物，希望她快點吃成胖子。由於她每天過於殷勤，明心很快發現她的用心。於是她故意在酒樓裏定下一桌美食宴請甄依柳。甄依柳抵抗不了誘惑，又大吃一頓。等她醒悟過來又後悔糾結的要死。

甄太醫似乎對吳成態度有所改善，他或明或暗地指示吳成將華佗麻醉藥的藥方幫他拿到。得到甄太醫的青睞，吳成受寵若驚。他有意識地接近和觀察華佗研究麻醉藥，華佗對他沒有絲毫戒心，不僅將自己的藥方給他看，還坦然地將藥方中所用草藥擺在他面前。他告訴吳成麻醉藥還在研製階段，重要的不是配方，而是準確的劑量。吳成將這些彙報和給甄太醫，甄太醫很不滿意，他需要的是最終的成果而不是過程。華佗繼續用麻醉針法給曹操治病。但曹操的侍衞每一次都要檢查他使用的針上是否有毒。這讓華佗很不高興。治療一段時間後，曹操反映頭痛雖有改觀，但最近感到身體疲乏無力，昏昏欲睡。華佗安慰他可能公務繁忙所致，並稱他自己也有這種感覺。其實這是劉太醫下毒所致，長此以往最後會導致癱瘓。劉太醫從眼線那裏得知曹操出現了中毒的症狀非常高興，感到離除掉曹操光復漢室為期不遠。關羽帶了醬牛肉來找華佗喝酒，為了吃醬牛肉時蘸食醋，華佗親自倒了一碗端了過來，手指因沾上食醋變成墨綠色。華佗驚覺這是中毒的症狀。他緊張地驗證了天來、喜蓮和明心，幸好均無中毒症狀。經過他和關羽的分析，華佗很快發現有人借他之手想害曹操，並非常高明地沒有把藥下在針灸針上，而是根據華佗的習慣把毒藥下在他常用的用來拭針的布上。關羽為讓華佗心無旁騖地調查此事，特意將天來帶到自己那裏，讓華佗放手做事。華佗很坦然地將這件事報告給曹操，並把懷疑對象鎖定在劉太醫身上。他決定設一個局，引得兇手自己上鈎。曹操表情陰鬱，對政敵借華佗之手暗害自己無孔不入的做法非常憤怒。劉太醫又一次去為明心看病時，華佗假説有事故意離開，劉太醫趕緊又往華佗的針灸包裏的布上下毒。甄依柳為接近吳成無所不用其極。她謊稱生病，點名要讓吳成為自己醫治。甄太醫對妹妹毫無廉恥地對吳成死纏爛打無計可施，他告訴吳成自己最痛恨靠裙帶關係上位的男人。可暗地裏他又安慰甄依柳，自己一定想辦法幫妹妹達成心願。

劉太醫走後，華佗驗證了針灸包裏的布，果然塗了毒藥。華佗將此情況報告給曹操，曹操非常氣憤，自問自己沒有虧待太醫院的人。華佗知道曹操的脾性，怕他亂殺無辜殃及他人，所以提前勸他不要因此事傷害其他人。曹操派出去的人暗中跟蹤了劉太醫，找到了他們的秘密據點。當晚劉太醫等人的帶頭大哥也到據點跟他們議事。曹操聽到彙報，親自帶人來捉拿劉太醫等判賊。據點望風的人發現官兵後，向屋裏的人發了信號。等曹操帶人進去後發現了劉太醫等六個叛賊。曹操心思縝密，發現了桌子上有七個茶碗，便知有一人逃脱。劉太醫的行為惹的曹操勃然大怒，他將眾叛賊滿門抄斬後，又下令讓全太醫院的太醫們到現場觀看劉太醫等人腰斬之刑。眾太醫看到腰斬的血腥場面，嚇的瑟瑟發抖，曹操要的就是這種殺雞儆猴的警示效果。華佗得知消息後想面見曹操，曹操卻讓屬下攔住他。華佗最後見到曹操後，責怪他不守信諾，亂殺無辜。曹操與華佗觀念不一，都説服不了對方，華佗氣的拂袖而去。甄太醫在太醫院裏處處排擠吳成。不僅讓吳成如下人一般打掃衞生，還幫着成心欺負他的人，不為他主持公道，最後甚至要求他把桌子搬到外面的雨地裏辦公。吳成忍氣吞聲受盡屈辱。甄依柳卻在雨地裏為他撐傘，不顧哥哥的反對無條件地支持和幫助吳成。那一刻吳成發自內心的感念甄依柳對自己的深情。當晚，吳成拿着禮物到甄府要送給甄依柳，甄太醫旁敲側擊地暗示吳成最好攀上他這個高枝成為自己的妹夫，那樣至少會少奮鬥20年。吳成從邁進甄府大門的時候就已經打定主意，攀上甄太醫，拋棄明心，反正自己接觸明心的初心就是要獲得她的好感後再拋棄她，以此折磨華佗為惠娘報仇。吳成開始主動親近甄依柳，甄依柳在吳成的柔情下倍感幸福。吳成故意在她面前訴説自己在太醫院無人問津。結果次日吳成的桌子不僅搬回太醫院屋裏，還有許多名媛到太醫院點名要讓吳成看病。吳成看到眾太醫羨慕的眼神心中暗喜，感到自己終於揚眉吐氣。

吳成一上午看了七個病人，雖然累但卻有成就感。胖妹甄依柳為吳成送來食物，心疼他看了七個病人。吳成一下子就明白過來，那些病人都是甄依柳請來的。甄依柳拉着吳成的胳膊引得太醫院眾太醫圍觀，吳成臉上有些尷尬。甄太醫此時過來讓太醫們將吳成的桌子從大廳搬到裏面的房間，眾太醫無不羨慕，吳成非常滿足。為感謝甄依柳，吳成第二天早上打扮的衣冠楚楚把甄依柳約到一個大酒樓，為她準備了一桌子的美食。甄依柳卻不高興，認為約會應該逛街或放風箏等。吳成拗不過她，只得陪着她逛街。在街上甄依柳高興的手舞足蹈，引得路人紛紛側目。吳成覺得非常丟人，只得裝出擦汗的樣子遮住自己的臉。甄依柳要吳成陪她去做衣服，那個綢緞莊是他經常陪明心去的。老闆看到吳成竟然領的不是明心很是吃驚。此時明心也和喜蓮出門逛街散心。吳成像做賊似得生怕碰到熟人。哪知他看到華佗正朝這裏走了過來。他故意將染料弄到甄依柳臉上，甄依柳到屋後去洗臉時，華佗走了進來。華佗警告吳成不要踐踏兩隻船傷了明心的心。正説着明心果然逛到此處看到了他們。吳成十分驚慌，華佗替他打着掩護，説吳成是來給她買三天後的生日禮物。明心很感動，吳成卻因為不知道明心的生日而顯得很意外和驚慌。剛應付走明心和華佗，甄依柳洗完臉回來。吳成讓夥計帶她去量衣服尺寸，等她離開後他交待老闆將選中的衣料按照甄依柳和明心的尺寸各做一套，做好後送到太醫院。甄依柳聽到了他們的對話。甄依柳回去後想到必須先下手為強。她偷偷地買回了合歡散，準備下到酒裏讓吳成喝下。明心生日那天，準備了一大桌豐盛的飯菜等吳成回來慶祝生日。哪知，吳成被甄依柳軟磨硬泡地拉走。吳成惦記着與明心的約定，急着想回家，怎奈甄依柳硬拉着他喝酒。數杯酒後，吳成覺得身上發熱，甄依柳露出計謀得逞後的興奮和激動，她告訴吳成自己在酒裏下了合歡散。吳成想逃離，但已經來不及了。明心見吳成失約非常難過，站在門口望眼欲穿地等不到他回來。深夜，吳成拖着疲乏的身體沮喪地從甄府回來。華佗上前批評他不該在這一天失約傷了明心的心。

華佗在門口等到吳成回來後，責怪他不該在明心生日這天失約。明心這時也準備到門口去等吳成回來，剛走到門口就聽到華佗與吳成的談話。明心清清楚楚地聽到了這些天吳成鬼鬼祟祟早出晚歸發生的事，明心非常難過。吳成回來後，明心故意問他這麼晚他去了哪裏。吳成不知道明心已得知真相，於是謊稱自己為明心的眼疾操心，路上遇到賈太醫與他探討病情。明心心都寒了，又問他一次，他還是堅持這樣回答。這時與華佗討論了一晚上病情的賈太醫從華佗房裏走了出來。吳成知道一切都敗露了。吳成沒有為自己的行為有一絲愧疚，他反而告訴明心自己馬上要與甄依柳成親，因為他們有了夫妻之實，如果明心為這些年的感情不甘心的話，自己可以跟甄太醫請求讓她做自己妾室。明心至此徹底看清吳成醜陋的真面目，更對於他無恥的行徑異常憤怒。她狠狠地扇了吳成一耳光，算是對他們之間感情的了結。明心傷心欲絕，一刻也不願多留，立刻收拾了行李離開。華佗去關羽府上接天來。關羽見天色已晚勸他們歇息一晚再走。次日清晨，華佗等人正準備離開時，曹操得知消息堅持要為華佗踐行。席間曹操與關羽、華佗正談笑風生，一直默默站在一旁的天來突然從懷裏拿出準備已久的小刀朝曹操刺去。曹操反映敏捷躲了過去，華佗不知道天來怎麼會作出如此瘋狂之舉。從來沒有開口説過話的天來突然指着曹操大罵。他們這才知道天來竟然是呂伯的孫子。華佗拉着天來拼命逃離。曹操的侍衞正要追趕，關羽擋住了他們。等他們最後追出去時，華佗已帶着天來逃到山林。華佗見情勢危急，讓天來躲在草叢中，他自己將曹軍引開。曹軍最後抓住了華佗，曹操因為天來逃竄後患無窮，於是發通緝令追捕天來。曹操最後放了華佗，派人暗中跟蹤他。華佗找到天來的藏身之地，卻只看到一條帶血的天來的手鍊和他的鞋子，現場血跡斑斑。華佗驚恐地四處尋找，在一處山洞華佗看到天來被撕碎的衣服和斑駁血跡。華佗傷心欲絕。曹操得知天來可能被野獸吃掉，於是撤銷了所有的通緝令。其實天來是被劉太醫那夥人劫走。他們一夥人中的帶頭大哥原來是賈太醫。賈太醫心懷光復漢室的志向，在得知曹操的通緝令後，暗中派人先抓了天來，然後偽裝成天來被野獸吃了的現場。他看中天來對曹操的刻骨仇恨，覺得稍加培養他一定會是曹操的心腹大患。華佗帶着明心回到譙郡，縣令看到明心鬱鬱寡歡很是疑惑。華佗回到家中將師兄吳成卑鄙無恥的行徑都告訴了華父。華父沒有料到吳成竟然是這種人。京城甄府裏華燈高照喜氣洋洋。吳成正與甄依柳舉行婚禮。甄太醫對吳成入贅甄府依然是一副高高在上的樣子，甚至都不願吳成稱呼他為大哥。吳成感到很受傷。

明心從京城回來後就一直茶飯不思，始終走不出吳成的陰影，眼看她日漸憔悴，眾人都看在眼中急在心裏。這一日喜蓮的好友小云過來看望喜蓮，告訴她自己剛從京城回來。去時正碰到京城有人在辦喜事，聽説是太醫院吳起娶甄太醫的妹妹。她還聽説吳起之前就有一個相好的，但他一直瞞着那個女人與甄太醫妹妹來往，他揹着她與甄太醫的妹妹遊山玩水，早就暗渡陳倉，然後故意氣走相好的。所以他的相好在京城就變成了別人的笑柄。明心在門後偷聽到這些話，對吳成的最後一絲掛念都沒有了。這時縣令走過來問小云聽到的情況是不是屬實，縣令聽後氣的口吐鮮血，暈了過去。明心嚇的從閨房裏出來，趕緊叫來了華佗。華佗來後仔細診斷後説縣令這身體以後千萬不能動怒，否則後果不堪設想。明心趕緊答應父親好好生活珍惜自己，不惹父親生氣。明心離開後，躺在牀上奄奄一息的縣令見勸解明心的目的已達到一躍而起，根本沒有生病的樣子。原來這些都是華佗想的讓縣令裝病勸明心的計策。吳成因為背靠甄太醫如今在太醫院混的揚眉吐氣，他沾沾自喜洋洋得意。哪知一日偶聽到太醫院的太醫們背後議論他，都説他沒什麼真本事，至今沒見他有什麼特別的案例。又説他沒有師弟華佗強，華佗至少還有一個麻醉藥，他完全就是吃軟飯的，而且還是甄依柳這種又肥又膩的軟飯。這些話深深地刺激了吳成。吳成開始疏遠甄依柳，卻惹得甄太醫十分生氣。甄太醫警告他搞清自己的地位，不要以為自己現在混出來了。吳成只得對甄依柳態度改善，這時又聽到她説懷孕了，吳成發自內心地感到高興。胡半仙突然來太醫院找吳成，讓他求甄太醫寫一封求情信給譙郡縣令，讓他恢復自由之身回到譙郡。吳成開始不答應，胡半仙搬出之前自己幫他找病人結果害死人家的事威脅他，吳成只好答應胡半仙，把他帶到甄太醫面前。甄太醫答應幫他説情，但前提是他幫自己偷到華佗麻醉藥的藥方。胡半仙答應了。胡半仙揹負荊條跪在縣衙門前負荊請罪，並把甄太醫寫的求情信交給了縣令。他裝出一副痛改前非的樣子，信誓旦旦地保證會將功補過，全力配合華佗救治明心的眼睛。縣令饒恕了他的過錯，胡半仙感恩戴德千恩萬謝。華佗根據之前在京城與賈太醫探討研究出的方案為明心排毒，讓她排毒後好好靜養。胡半仙一心惦記着華佗的麻醉藥方，這一天他偷偷溜進華佗房間，剛剛看到配方就聽到華佗回來的聲音。他趕緊假裝喝水端起桌子上的湯藥就一飲而盡。哪知這是華佗正在研究的麻醉藥，胡半仙喝後不久就流了鼻血，神質也有些混亂。華父看到這一切，神色凝重地叫走了華佗。

胡半仙一向古靈精怪辦法多，喜蓮就求他想想辦法讓明心走出陰霾。胡半仙約大家一起去放風箏。華佗放的風箏又高又穩，明心不服氣，要和華佗比試。於是明心如孩童般忘卻了煩惱，快樂地放飛風箏。喜蓮和華佗看到明心臉上盪漾着許久未見的笑容，兩人也欣慰地笑了。胡半仙推説自己的風箏斷了線飛走了，要一個人離開去找風箏。誰知他偷偷地跑到華佗房間，找出麻醉藥的藥方快速地抄撰下來。華佗回來時看到胡半仙神色慌張滿頭大汗地站在自己房間。他狐疑地打量着胡半仙，胡半仙趕緊搪塞過去。胡半仙依照約定將抄下來的藥方傳給了甄太醫派來的人。吳成別有用心地截留下配方，他激動地拿着藥方欣喜若狂。他偷偷地依照藥方剛配好藥，就聞甄太醫回來了。他手忙腳亂地將配好的藥胡亂塞到藥架上，然後裝作如無其事的樣子去見甄太醫。過了不久，甄太醫問下人為甄依柳購置保胎藥的事，因為前一天就聽到説只剩最後一包。哪知下人説丫鬟小娟今天發現還有一包，所以先熬好藥給甄依柳端了過去。吳成隱約感到不對勁。吳成慌慌張張地去房間看藥架上的藥，發現自己配的麻醉藥不翼而飛，而自己慌亂中放的位置正好是放保胎藥的位置。他心急火燎地跑去阻止甄依柳喝藥，可等他到時甄依柳已經一滴不剩地喝完所有湯藥。吳成緊張地看着甄依柳有沒有異常，結果就突然發現她下身開始流血。吳成驚慌失措地讓人請產婆。產婆接生下孩子，孩子只哭了一聲就沒了呼吸。吳成心知肚明，他卻故意責怪產婆。產婆急忙撇清解釋説，甄依柳生產時神質有些不清而且氣息微弱，她認為她是吃錯了什麼後導致的早產。甄太醫慢慢地對保胎藥產生了懷疑。他質問吳成讓他説實話，不然就報官，讓太醫們查清藥碗裏湯藥的成分。吳成最終承認自己截留了麻醉藥藥方才釀成大錯害了自己的孩子。甄太醫恨的咬牙切齒要嚴懲吳成，甄依柳又哭着哀求哥哥放了吳成。吳成走在街上突然被藥店老闆拉進藥店，老闆遞給他一支上好的野人蔘。吳成不明所以，老闆接着為他引薦來自無縣的縣令沈大人。沈大人説一年一度的貢藥採買要開始，一直都是甄太醫在組織這項工作。他希望無縣能成為貢藥提供方，請吳成代為引薦他給甄太醫。沈大人給甄太醫送了一箱珠寶，吳成吃驚地睜大了眼睛。但甄太醫笑納後沒有給沈大人肯定的回答，他告訴吳成，歷來官商勾結做生意是很正常的事，沈大人的只是小意思，真正大手筆的還在後頭。吳成驚呆了。集市賭場邊，一個叫華勝的年輕人又來到賭場，賭場夥計苦口婆心地勸華勝不要再賭了，因為他家的生活已經捉襟見肘。掌櫃牛二見夥計把客人往外推十分不滿。華勝不予理會硬是要賭，結果一會兒的功夫又輸個精光。華佗和明心站在不遠處冷冷地看着華勝發生的一切。

華佗看華勝賭錢，恨其不爭，責怪牛二不應該將譙郡頂拐這種強身健體的活動弄成賭局。牛二不服，於是華佗主動提出跟牛二的人賭一局，如果嬴了以後牛二就能再開頂拐的賭局。牛二答應了。明心還主動拿出所有的銀子支持華佗。華佗最後嬴了比賽，牛二雖然不甘心但還是願賭服輸，撤銷了頂拐的賭場。甄太醫向曹操推薦無縣作為貢藥採辦地，還力誇無縣山好水好出好藥。其他大人卻提出異議，甄太醫還在辯解，曹操卻讓人把無縣的沈大人帶到眾人面前，看到沈大人被打的遍體鱗傷，甄太醫知道自己受賄的情形曹操已瞭如指掌。曹操最痛恨別人欺騙和愚弄，於是殺了沈大人，杖責了甄太醫。曹操問甄太醫是否知道哪裏錯了，甄太醫卻答非所問。曹操見他不能意識到自己錯誤，於是繼續杖責。吳成冒險將曹操杖責甄太醫的真實想法説了出來，曹操和甄太醫都很詫異吳成竟然揣摩出曹操的真實意圖。甄太醫屁股被打的皮開肉綻，已不能親自去採辦貢藥，於是讓吳成作為官方代表親自督辦採辦之事。因為無縣被取消資格，於是甄太醫將曹操的故鄉譙郡列為採辦地。曹操默許了。甄太醫為此專門把兒子小甄叫回來，陪吳成一起督辦採辦。甄太醫還一反常態，對吳成和顏悦色，還讓他改口叫自己為大哥，並推心置腹地理解吳成在太醫院被排擠的窘境。吳成非常感動，他還乘機提出讓甄太醫允許他另娶一妾為自己傳宗接代，因為甄依柳因為上次的早產失去了生育能力，吳成不想斷了後。甄太醫目前需要吳成為自己賣命，於是忍氣吞聲地答應了他的請求。吳成帶着小甄到了譙郡，以官方督辦的欽差身份與縣令接洽。吳成此次覺得自己是衣錦還鄉，於是在縣令面前趾高氣揚。縣令不卑不亢，對吳成背信棄義和忘恩負義十分的鄙視。華佗此時正在用豬試驗麻藥的功效，胡半仙突然來告知他吳成竟然跑到縣衙面前向縣令提親，想要迎娶明心。華佗急匆匆地趕到縣衙，吳成正厚顏無恥地説自己是來兑現諾言的。因為之前縣令説等他功成名就之時就可以迎娶明心，如今他覺得時機已到。縣令和明心對他這種無恥的行徑非常的氣憤。華佗趕到，斥責吳成，吳成懷恨悻悻而走。

曹操頭疼難忍，賈太醫親自為他醫治開了藥方。寫好方子後賈太醫讓人去煎藥，但曹操制止了他，而讓下人把藥方拿到太醫院審核。賈太醫回去後，那些叛曹的人趕緊問他往曹操藥方做手腳是否成功。賈太醫無奈的告訴他們，曹操生性多疑，竟然將下方、拿藥、煎藥、送藥分別交給不同的人去辦，如此很難做手腳。吳成因為譙郡差收藥官，於是主動向縣令推薦由小甄擔任。但縣令卻告訴他曹操親自任命了華佗為收藥官。華佗本不願插手此事，但明心不喜歡吳成那種得意的樣子，於是勸華佗接下此任。吳成得知華佗要去祭拜惠娘，於是故意早他一步到了惠娘墳前。他知道華佗在身後，於是故意裝出一付顧全大局而又不被人理解的委屈的樣子。華佗以為他是真的痛改前非，決定再相信他一次。華佗作為收藥官對所有的藥商進行了甄選，最後定下藥商的名單，並上報給縣令。等他從縣衙出來，華勝告訴華佗，雖然自己的藥品沒能入選，但他還是要告訴華佗真相，原來那些入選的藥商根本沒有那麼多的貨源，而是互相拆借後欺騙華佗。華佗大吃一驚，趕緊到藥商那裏去核實。果然發現以牛二為首的藥商以次充好，幸虧發現及時，不然釀成大禍。牛二帶着一箱銀子找吳成請他高抬貴手，吳成以公事公辦的口氣讓牛二去找華佗，因為他才是收藥官。其實是因為他根本看不上那一箱銀子，覺得太少。牛二不甘心地離開又去找華佗。華佗拒收他送的銀子，但答應他晚上的宴請，牛二非常高興。哪知晚上的時候華佗將眾多的鄉鄰一起請到酒樓，説這些人都是自己的朋友，結果讓牛二狠狠地破費。牛二懷恨在心。牛二帶着一幫藥商到縣衙門口鬧事，説華佗徇私錄用堂弟華勝的藥物。其實華佗在驗收華勝的藥物時，確實看到他的藥成色和品相都十分合格。原來這是吳成的主意，他故意讓藥商們把藥品放到華勝藥鋪，等華佗驗收後，他們又集體回去把華勝藥鋪的好藥搬走，等牛二帶着華佗來驗證時當然驗到的全是華勝鋪子裏的差藥。華佗吃了啞巴虧，提出當場辭職。於是在吳成的建議下由胡半仙接任了驗藥官。胡半仙欣喜若狂。牛二拿着大量的銀子行賄吳成和胡半仙，胡半仙看到銀子眼冒綠光。吳成又提出這些是小錢，問胡半仙想不想掙大錢。胡半仙素來貪財，哪有不掙的道理，忙不迭的答應了下來。吳成和小甄把他帶到山上的一個小屋裏，屋裏堆放的全是次藥。胡半仙不解，於是小甄告訴他，他們準備用低買高賣的形式把這些次藥混入貢藥，然後藉機大賺一筆，現在只需要胡半仙在驗藥時做做手腳。誰知胡半仙良知未泯，覺得藥品關乎人命，不答應參與此事。因為胡半仙得知了吳成的計劃，吳成決定除掉胡半仙。晚上，胡半仙在卧室酣睡，一條毒蛇從門縫爬了進來，一直朝胡半仙的牀邊爬去，然後對準了胡半仙裸在外面的小腿張開了口。

胡半仙的慘叫聲驚動了華佗，等他出來看時就見胡半仙被毒蛇咬傷。華佗用嘴幫他吸出了蛇毒。胡半仙獲救後，拿着蛇偷偷去找吳成。胡父覺得毒蛇出現的太詭異，於是藉口要出去採藥，偷偷地跟在胡半仙身後，最後看到胡半仙氣憤地從吳成房裏出來。正疑惑間忽見吳成隨後出門，於是華父又跟在了吳成的身後。因為第二天是驗藥日，胡半仙為了躲避故意砸傷自己的腳在家休息。華佗於是代替胡半仙幫着驗藥。他請縣令幫忙去找華父，因為他昨晚出去採藥後到現在也沒回來，實在是放心不下。吳成聽到這些神色十分異常。這時大幫的藥商來到縣衙，吵鬧着要吳成退回他們行賄給吳成的錢，因為吳成並沒有幫他們辦成事。華佗念及師兄弟一場，不願看到吳成如此窘迫，於是自己出面幫他説情，讓他把受賄的錢退出後了事。最後華佗驗收完藥籤字後，吳成就帶藥回去了。這時，有衙役來報華父採藥墜亡。華佗非常震驚，想到華父晚上採藥離開時行色匆匆，他對華父的死非常懷疑，委託縣令幫他調查。華父的去世對華佗打擊沉重，幾天來他一蹶不振，不吃不喝，醫館徒弟和下人也紛紛離開。明心勸華佗如果真要孝順華父就要振興醫館，以此方式讓華父省心。明心的話深深觸動華佗，他開始打起精神。吳成將藥物運回存放倉庫時，因為藥品裏有好藥和次藥兩種，吳成交代屬下將藥品按先左後右的順序放置。哪知屬下一眨眼的功夫就忘了，記錯了順序，按照先右後左的順序放置到倉庫裏，將本應放在裏面的次藥放在了靠外面的位置。吳成回到家裏，為華父立下靈位拜祭。他內心尚存的一點良知讓他感到還是絲絲的愧疚。原來當晚他和小甄上山分貢藥和次藥時，跟蹤而來的華父發現並質問他。他和華父爭執時華父失足掉落懸崖，吳成一把抓住華父，但因華父剛正不阿致死都不願放棄告發他，於是他鬆開了抓住華父的手致使華父墜崖而亡。賈太醫為曹操治療頭疾，讓潛伏在曹府多日的天來為曹操端藥。曹操端起藥碗喝藥時，天來因為年幼膽小，手抖的厲害，最後被曹操看出異樣。正危急時曹操突然吐血倒地。賈太醫以為得手，就讓天來離開，自己將此消息去告訴眾反曹的人。哪知曹操根本無事，賈太醫他們突然遭曹軍屠殺，連天來也被曹軍四處追殺。

曹操因為自己差一點再次被毒藥所害心有餘悸，他覺得自己沒有信賴之人，因為賈太醫是太醫院的人，曹操連太醫院也不再相信。於是曹操將華佗從譙郡請來，讓他調查此次中毒事件。華佗來後很不願意插手官場爭鬥，但曹操告訴他這碗藥是天來端給自己的，也許華佗調查此案時可以找到天來。華佗很震驚，為了天來答應下來。華佗在查案時發現賈太醫的藥多了一味中藥附子，附子本沒有毒，可與賈太醫開的藥方裏的麻黃這味藥在一起就會產生劇毒。華佗百思不得其解，不知道這味藥是什麼時候怎麼加進去的。結果曹操卻通過分析知道問題出在送藥環節，於是他注意到藥壺裏有機關。只是他喝了毒藥為什麼沒有死，卻讓他們不能理解。不但他們不解，甄太醫和吳成也非常不解。於是他們同時懷疑到藥庫的藥品。華佗到藥房查看藥品，吳成急忙趕來制止。華佗最終查出問題出在藥品上，因為賈太醫用了次藥，藥性不強，所以曹操才撿回性命。但曹操卻要徹查此事，將與採辦貢藥的相關人等全部抓起來。華佗想獨自攬下此事，但曹操卻將吳成和小甄、縣令和華勝都抓了起來。甄太醫深懂曹操心事，他不怕貪官，卻痛恨反賊。於是他故意將所有過錯都攬到自己身上，將自己貪污的過錯誇大表達自己的忠心。曹操之子曹丕揣摩到曹操的心思，沒有追究甄太醫貪污的過錯，答應放了吳成和小甄。胡半仙拿着吳成與牛二的賬本讓吳成救出縣令，不然就把他和牛二勾結的賬本交出去。哪知吳成根本不予理睬，似乎不怕賬本。胡半仙將賬本交給華佗，華佗到牢裏問過華勝才知道原來貢藥之事竟然是華勝在裏面做了手腳，他因為欠賭債被吳成買通。如果華佗拿出賬本就害了華勝，如果不拿出來又救不出縣令。華佗非常糾結。誰知曹操在審案時，縣令拿出賬本承擔下一切過錯。縣令被判次日處決。明心走投無路決定找吳成説情。吳成對明心言語一番羞辱，明心為了父親忍辱負重，暫時忍下吳成的奚落。哪知吳成最後無恥地提出讓明心陪他一晚。明心震驚了。

吳成無恥地佔有了明心，明心讓他信守諾言明日救出父親。吳成卻嘲笑明心痴心妄想，他告訴明心自己跟她在一起一直是想報復她，他根本沒有喜歡過她，他只是想看到她被拋棄後痛苦的樣子。明心很震驚。接着吳成又告訴她一個讓她更吃驚的消息，原來之前甄太醫偷偷地到牢中警告過縣令，讓他認下所有的罪過，不然就會傷害明心的性命。甄太醫還告訴縣令，曹丕是自己背後的大人物，縣令是鬥不過他們的。所以縣令為了明心才在曹操面前認下了所有的罪。吳成言語中對明心充滿了鄙視和厭惡，稱明心就是個不祥之人，是她害了惠娘，害了華佗還害了她爹。明心得知所有的真相心如刀絞，自己白白失了清白之身卻沒有一點意義。悲慟之下吳成所言的她是個不詳之人一直如魔咒般縈繞在她耳邊。次日，華佗和明心等人趕到刑場。華佗請執行官夏候勇念在同鄉份上讓他們送行縣令。縣令告訴他們早在當年他投降董軍時曹操就起了殺心，這次不過是找個藉口，不是曹操不明真相，而是藉機殺他而已。他還告訴明心當年不是華佗害死的奶奶，自己一直不願意解釋是因為怕明心和華佗重歸於好。時至今日，他説出真相是想把明心拜託給華佗照顧，那樣自己才能安心上路。明心不能接受這個現實，一心求死要跟隨父親而去，縣令和華佗苦苦相勸後明心才放棄了死的念頭。縣令被處決後，華佗、胡半仙、明心、喜蓮四個人回到華家的醫館，華佗讓他們從此就在此住下來。明心因父親死後終日以淚洗面眼疾越發的嚴重。最終她在墳前祭拜父親時眼睛突然失明。華佗經檢查發現明心眼睛治癒的可能非常小，明心心裏很清楚自己的病情，她覺得配不上華佗這樣的好男人，為了不連累華佗，她狠心説出一些絕情的話想讓華佗討厭自己離開自己。可華佗卻下了決心從此對明心不離不棄。華佗給明心做了一支枴杖，讓她慢慢適應失明後的生活。考慮到明心現在的情況，為了更好地照顧她，華佗決定向明心表白，想給她一個安定的家。當他正鼓起勇氣準備當面嚮明心表白時，明心突然噁心欲吐。華佗趕緊為她號脈檢查 ，但結果讓華佗大吃一驚。

華佗為明心號完脈後不敢相信，他一言不發地衝出房間。眾人不知所以，胡半仙追出去也問不出來，於是胡半仙親自為明心號脈，竟然是喜脈。所有的人都震驚了。華佗痛苦不堪，明心更是羞愧難當。明心要華佗幫自己除掉這個吳成留給自己的孽種，因為這個孩子的存在無時無刻不在提醒自己受的屈辱，可華佗卻覺得孩子是無辜的，他不會幫明心打胎。明心痛哭着跑回縣衙，她捶打着肚子想自己打掉孩子。胡半仙看她堅持已見，於是決定幫她。明心將打胎藥端到手裏，正要喝時，華佗突然趕到打翻她手裏的藥碗，並告訴她自己明天就會讓八抬大轎來娶她，不僅娶她還要娶她肚子裏的孩子。明心雖然深愛華佗，可她不想讓華佗受這種委屈和屈辱。不管華佗怎麼表明自己對她的決心，明心始終不能坦然地接受華佗。華佗見明心心意已決，於是把自己配製的藥方交給胡半仙，讓他照料明心安心養胎，自己將尋訪名醫找到為明心治眼疾的方法。華佗揹着簡單的行李踏上了尋訪名醫的道路。剛出城就碰到一個衣衫襤褸的人踉蹌幾步突然暈倒在地。華佗檢查他有中毒症狀，救醒他後他驚恐的喊着讓吳太醫不要殺他。等他看清眼前不是吳太醫時，就向華佗娓娓道出他的經歷。原來他本是一個逃到京城的難民，被吳太醫救治後藏在一個山洞，並將他捆綁起來，每日裏不是給他喝藥，就是在他身上針灸。後來甄依柳發現了吳成用活人試驗麻醉藥，於是放走了這個難民，但讓他不要告發吳成。華佗聽説了吳成慘絕人寰的行為，給了難民一些錢和藥，讓他解毒和謀生。華佗找到吳成，讓他不要再做這種用活人做試驗的傷天害理的事情，他可以把麻醉藥的配方給他。甄太醫偷聽到他們的談話將吳成又責罵一通。華佗繼續尋訪名醫，在一個山林華佗失足從橋上掉落。等他醒來，發現自己在一個世外桃源，救他的是一個白髮白鬚仙風道骨的老人，還有一個古靈精怪的叫靈兒的小姑娘。老人看出華佗脾氣桀驁心有怨氣，於是故意為難他讓他磨一磨心智，改一改脾性。靈兒卻處處幫助華佗，責怪爺爺對他過於苛刻。沒想到華佗很有悟性，體會了老人的用意。老人對華佗很是滿意。

老人把華佗帶到他的藏書室，裏面有很多醫書孤本，華佗如獲至寶，如飢似渴地閲讀。如此數月過後，華佗惦記明心，估計她的孩子已出生。華佗寫信給明心時正碰到她的孩子出生，明心生了一個男孩，起名沸兒。華佗和靈兒在郊外採藥時，靈兒告訴華佗自己是老人撿回來的孤兒，家人拋棄時除了留給她一個晶瑩剔透的手鐲什麼信息也沒有。正説話間附近有獵户射中一隻老虎，靈兒看老虎是一隻剛生產的母虎，於是求獵户放了老虎。獵户卻因為母親風濕需要虎骨必須殺了老虎，華佗於是主動提出幫獵户母親治病，讓他放了老虎。通過給獵户母親治病，華佗告訴獵户他母親的病一些是因為病痛，更多的是因為孤獨，希望他多陪陪母親。老人很贊成華佗治病又治心的做法。華佗通過觀察，注意到動物常常活動精力充沛，想到如果人經常運動一定也會強身健體。於是華佗根據動物的形態研究創造出了模仿動物形態的體操，起名為五禽戲，用來模仿鍛鍊強身健體。幾番寒暑過後，華佗的醫術、心態和心境都有了很大的提高。老人甚是滿意。一日明心和喜蓮帶着沸兒上街，結果喜蓮看到了吳成，幾個人趕緊往回走。吳成是回來祭拜惠孃的。結果牛二為了留下討好吳成，主動告訴他明心有個兒子，但 明心並沒有成親，所以不知道孩子到底是不是華佗的。吳成心中生疑，想到明心家裏去看她和孩子。儘管胡半仙和喜蓮百般阻撓，但吳成還是衝進院子，看到了失明的明心。吳成很吃驚明心的樣子，還想再看看孩子時，突然下人來催他回去給曹操看病。曹操頭疾越來越嚴重，太醫院裏的太醫根本束手無策。華佗此時在山中已準備下山給周瑜看病，想借看病之機勸周瑜不要殺戮，多拯救蒼生。靈兒捨不得離開，但老人勸她跟華佗一起下山歷練。為了讓靈兒放心，老人故意稱自己如果不是因為要照顧靈兒早就雲遊四海了，但揹着靈兒他偷偷告訴華佗皆因自己已算到不久要離開人世，所以才將靈兒託付給他。臨走他告訴華佗只有心繫蒼生才為大醫。華佗將此教誨銘記於心。華佗與靈兒剛下山，路途就遇到夏候勇正在追殺一個人。華佗心生憐憫，救下此人併為他包紮好傷口。此人激動地看着華佗淚如雨下，喊出了華叔。原來他竟然是四處顛沛流離的天來。華佗心疼不已，讓他從此跟着自己不 要流浪。

華佗為周瑜醫治失眠彼有奇效，周瑜非常滿意，因為他廣招名醫都沒有醫治好，華佗手到病除讓他免除了多日來失眠的痛苦。這時有屬下來報，稱曹操軍營中出現瘟疫，曹操十分的頭痛。周瑜卻覺得這是難得的出兵滅曹的時機。華佗乘機讓周瑜放棄殺戮，稱只有這樣才會心平氣和，也才不會再失眠。但周瑜否定了他的建議。曹操營帳之內是人心惶惶，眼看大敵當前軍營卻生瘟疫，如此必將不戰而敗。曹操質問吳成，吳成誠惶誠恐地回答若要治癒最少要半個月之久，曹操大怒。於是吳成建議將患病的將士屍體丟入江中，讓他們隨江而下流入東吳，將瘟疫帶進東吳。曹操對吳成生為醫者卻生出如會危害更多人性命的念頭側目。但為了戰事曹操還是接受了吳成的建議。華佗為周瑜治療失眠後提出要前往曹營救治受瘟疫感染的將士，因為在他眼裏只有病患，沒有敵我。周瑜非常生氣，此時有屬下來報，臨江邊的村民受瘟疫感染。華佗自願到村子裏去治療瘟疫，周瑜卻不想村民將瘟疫帶入軍營，想封閉村子，情況不對時就焚燒了整個村子。既便如此，華佗還是準備前往村落，靈兒也不顧華佗的阻止堅持跟他去了村子。周瑜手下大將奉周瑜命令，給華佗三天時間，三天之後會屠村。華佗義無反顧地進到村子。有些村民十分的恐慌，開始往村外逃竄，結果被守在村外的官兵用箭射死。其他村民絕望之時得知華佗是專門來醫治瘟疫的大夫重又燃起生的希望。這時有村民發現江邊漂流過來的屍體。經辨認是曹軍士兵的屍體，靈兒建議大家將曹軍的屍體全部燒掉，防止屍體往下流污染下游的村落。結果在處理屍體時，村裏的劉奶奶發現了孫子大寶的屍體，哭的死去活來。靈兒去劉奶奶家照顧她時，劉奶奶認出她手上獨特的手鐲。原來靈兒的母親是個大家閨秀，當年與一個軍官私奔有了靈兒後因未婚先孕後遭到家族的排擠，最後因為身體羸弱生病去世，那個軍官劉奶奶也不知姓名，只知道他擅長丹青。靈兒沒有問到父母的下落，很失望。天來聽説華佗在瘟疫村有可能被燒村，着急的趕緊過去幫忙。守村將軍託天來帶話給華佗，可以在晚上偷偷放他出村，但村民們卻要被燒死。天來知道華佗的秉性，一口回絕了將軍。哪知華佗卻提出自己願意出村，他要利用將軍的士兵搬運草藥，表面用來燒村，實際是將草藥點燃煙醺去除瘟疫。此舉既除了瘟疫又保全了全村村民的性命。周瑜非常高興要給華佗賞賜，華佗什麼也不要，只提出准許他過江。但周瑜卻不允許，因為他知道華佗會去曹營救那些得瘟疫的曹兵。於是他便將華佗軟禁起來。曹操得知華佗三日內便幫江東除了瘟疫，對吳成一干人等非常生氣。吳成得知華佗又一次搶了他的風頭，吃驚又不甘。此時華佗因為被軟禁，便在住處教下人們一些五禽戲。周瑜過來看到後十分不解，但聽華佗説可以強身分體，便吩咐下人們好好學習。

周瑜的士兵見華佗帶着一幫下人在練五禽戲，並將他們帶到户外練習，於是準備向周瑜稟報，誰知此時周瑜正在議事，屬下只得等在旁邊。等周瑜議完事聽了屬下的彙報大發雷霆，趕緊派人追趕。此時華佗果然帶着靈兒和天來逃跑，華佗準備渡江去曹營中治療瘟疫。哪知天來突然打暈華佗並將他捆了起來。華佗甦醒後天來跪在他面前，他希望華佗原諒他的不得已行為，因為曹操與他有不共戴天之仇，自己又沒有能力殺曹操，所以他不希望華佗去給曹營的官兵治病，哪怕將來曹操死後自己以命抵那些無辜官兵的性命。華佗説服不了天來急的正不知如何是好時，走散了的靈兒這時找到華佗和天來藏身的山洞，靈兒也支持華佗的觀念，於是三人劇烈爭執起來。爭吵聲驚動了正在樹林巡邏的夏候勇，夏候勇看到天來正要殺他，華佗拼命救下天來。東吳的追兵也已趕來，夏候勇想帶着華佗撤離。在與東吳追兵爭鬥間，天來和靈兒失足跌下山坡，夏候勇拼命救出了華佗。華佗到了曹營，面對曹操還是他的那一番勸曹操不要殺戮的言辭。曹操為了治療瘟疫讓軍營的太醫們都到了議事大廳，結果華佗很直接的讓吳成出去，自己不願與他為伍，因為像他那種讓病屍隨江而下感染更多人的行為不僅沒有醫德連人性都沒有了。吳成氣的火冒三丈，無奈華佗堅持曹操支持，吳成只得悻悻而走。曹營得瘟疫的官兵得到華佗的醫治很快轉危為安，眾將士對華佗感恩戴德。這一次前方打仗受傷的士兵因重傷在華佗面前眼睜睜地死掉，再加上吳成的冷嘲熱諷，華佗意識到自己改變不了時局，不能阻止殺戮，做不了蒼生大醫，內心非常失落。因為曹營裏瘟疫已治好，華佗想離開曹營，曹操苦勸後稱曹營中還有一人生病，所以他不能離開。華佗在給病人劉二寶醫治時，發現劉二寶其實沒有病，原來他就是東吳劉奶奶的二兒子。他因大哥得瘟疫而死，家中老母無人奉養，所以才讓華佗幫他裝病想避開戰爭。吳成得知這個消息後向曹操告密，曹操對劉二寶臨陣脱逃擾亂軍心的行為大怒，他對劉二寶進行了嚴懲。華佗已對曹操徹底失望，於是離開了曹操準備回到家鄉。華佗回到家鄉，看到了闊別已久的明心，明心面對華佗更是百感交集，兩人淚如雨下。華佗見沸兒老是被別人欺負，於是教他學五禽戲強身健體。天來和靈兒準備回譙郡找華佗，兩人走到城門口被守城侍衞追殺。他們最後跳入潭中才逃脱出來。

靈兒和天來從潭中爬上來後，靈兒受寒凍的渾身發抖。天來生了火後看靈兒瑟瑟發抖昏迷不醒的樣子，急的沒有辦法後脱了外衣將靈兒抱在懷裏。一夜過後，靈兒終於醒了過來。天來按照靈兒的描述給靈兒找來草藥，將靈兒救了過來。吳成這一日乘轎路過譙郡，頑皮的沸兒不小心用彈弓打到吳成的手下，手下與沸兒正拉扯時驚動了轎裏的吳成和正在尋找孩子的明心。吳成注意到這個孩子，纏着明心問沸兒是誰的孩子。明心拉着沸兒快速離開。吳成不死心，又向胡半仙打聽，胡半仙已改過去貪財沒有原則的性子，他拒絕了吳成的銀子和拒絕回答沸兒的身世。哪知隔天吳成又來看明心和沸兒，他拉着明心咬定沸兒是自己的骨肉，不停地糾纏明心，明心嚇的趕緊離開。一日天來拉着靈兒躲過追兵，逃脱到集市上，結果遇到正帶着明心和沸兒的華佗。華佗原諒了天來過去的事，叔侄倆冰釋前嫌。天來和靈兒的到來起初讓這個大家庭非常的熱鬧，但靈兒不拘小節地與華佗親近讓喜蓮很不高興。她覺得明心與華佗好不容易苦盡甘來，眼看就要修成正果，靈兒的突然到來不免讓華佗與明心會心生出嫌隙。胡半仙看出了天來對靈兒有意，於是勸天來勇敢表達自己的心意。吳成離開譙郡時又一次來到華府糾纏明心，華佗為保護明心和沸兒，在吳成硬説沸兒是自己孩子時，華佗站出來宣佈沸兒是自己的孩子，並當着眾鄉親的面故意説自己當年不負責任拋下明心母子，現在他要承擔責任娶了明心。眾鄉親看到這一對苦命鴛鴦終成眷屬，都齊心祝福。吳成悻悻而走。靈兒心中早就對華佗暗生情愫，看到華佗與明心兩情相悦的樣子，傷心地跑了出去。天來看靈兒跑出去追了上去，勇敢地向靈兒表達了自己對她的情意，靈兒卻告訴他自己有喜歡的人了，是華佗。

天來得知靈兒的心上人是華佗後傷心難過的以酒消愁。結果喝的酩酊大醉，在街上遇到了正準備連夜趕回京城的吳成。吳成連哄帶騙地把天來帶上馬車，想把他交給曹操加官進爵。華佗正和明心等人喜氣洋洋地準備明天的婚禮，胡半仙急忙趕到告訴華佗，天來被吳成帶上馬車往京城駛去。眾人分析以吳成的人性絕對是要拿天來換得自己的仕途。華佗放下婚禮的事，趕緊往京城趕去救天來。吳成假説要幫天來刺殺曹操，將天來藏在密室。暗地裏他去向曹操舉報天來，哪知曹操外出。於是吳成為安定天來，故意慫恿挑撥天來説華佗奪走了他們兩個人心愛的女人，誰知天來根本不理會吳成的挑撥，在他心裏華佗就如同父親一般。吳成回到甄府甄依柳為他到譙郡認孩子的事又吵又鬧，還搬出哥哥甄太醫為她主持公道。甄太醫將吳成罵的狗血噴頭，稱不可能讓他帶個野種回來繼承自己的家產。吳成見甄太醫對自己這個入贅妹夫鄙視和不屑，心中十分不滿且懷恨在心。在他準備去舉報天來時，他突然又起了其它的念頭。他先哄得甄依柳高興，然後乘機將化名為呂仇的天來讓甄依柳推薦給甄太醫，因為天來本身就有一些醫學基礎，加上甄依柳的推薦，甄太醫收留了他。吳成之前私下跟天來商議，哄騙他説讓他在甄太醫處卧底，説甄太醫貴為醫丞接觸曹操的機會比較多，將來要報仇有的是機會。於是天來爽快地答應了下來。他果然不負重望，在甄太醫考核時對答如流，很快獲得甄太醫的重視。甄太醫還承諾如果天來將來足夠優秀，自己還會推薦他給曹操。天來心中暗喜。華佗和靈兒到甄府找吳成，讓他交出天來。但吳成一口咬定自己根本沒有見過天來，華佗沒有證據只得作罷。他和靈兒決定在京城暫時安頓下來，支個攤位看病問診，慢慢尋找天來。一日華佗在街市遇到官兵給難民施粥，但粥裏米粒太少，難民們根本就不能裹腹。華佗看施粥的官員像是有頭疾，於是心生一計。他趕緊走在官員前面，吸引他到自己的醫攤看病。然後華佗一番神乎其神地忽悠，又亦真亦假地開出了真的藥方，然後讓他去找集市賣胡瓜的人那裏買瓜，並將胡瓜的療效渲染的包治百病。最後附近的達官貴人們聞訊紛紛去那裏買瓜。賣瓜人對華佗感激不盡。吳成在太醫院裏的病人越來越少，才得知很多人都直接去了門口華佗的藥攤面前看病了。吳成氣急敗壞，偷偷地觀察華佗。一日為百姓施粥的方大人來華佗攤前看病，華佗以為他和貪污的那些官員是一夥的，所以提出了很高的診金。方大人為官清廉，付不起診金，氣的起身而走。結果把錢袋落下。華佗拾起錢袋追了上去。

華佗追上方大人，正聽到他和下人説話。下人讓他不如做些手腳貪一些錢財做為診金，結果遭到方大人嚴厲的呵斥。華佗才知道誤會了方大人這位清官，於是主動為他看病。吳成通過觀察發現，華佗與瓜農互相勾結，故意抬高診金，騙的達官貴人們紛紛搶購胡瓜。而後瓜農將多賣的瓜錢交給華佗。吳成為此狀告到曹操面前，原想讓曹操以行騙之罪處罰華佗，哪知曹操卻從達官貴人們能高價購買胡瓜看出這些人貪贓枉法。吳成沒想到事情發展成這樣，有些意外。而華佗卻將這些額外得到的錢全部用來施粥。曹操對華佗這種雖然爛卻有效的法子非常讚賞，有彼對其脾性的意思。華佗又親自試藥，試驗前他吩咐靈兒一旦他有事及時幫他找大夫。結果華佗試了藥後就頭暈眼花，他感到自己不行了，於是趕緊寫下遺書。曹操的小兒子曹衝病重，太醫院久治不愈，於是曹操讓人去請華佗。哪知去的人很快回復回來説華佗去世了。曹操非常難過，想到與華佗的交往，覺得華佗是一位難得的摯友，不禁潸然淚下，曹操決定親自去祭拜他。他讓曹丕安排由吳成為曹衝治病。曹丕卻暗暗交待吳成治療曹衝時只可治標不能治本。吳成驚呆了。吳成將曹丕的指令告訴了甄太醫，他們分析曹操年事已高將來會傳位給誰。此時他們都惶恐怕站錯了隊將來禍及自身。於是甄太醫見吳成站到曹丕隊伍時，甄太醫就選擇了站在曹衝那支隊伍，將來不管誰嬴到最後，他們都可以實現雙贏。此時華佗的死訊傳到譙郡，明心悲痛欲絕，帶着喜蓮等人趕到京城來祭拜他。明心聽了喜蓮讀的華佗的最後的遺囑，得知華佗為試藥拿自己的性命做賭注，信中又最不放心明心，字字句句字裏行間無不表露出對明心的關心和放心不下。華佗的深情讓明心更是哭的泣不成聲。這時吳成假惺惺地來祭拜華佗，可眼睛卻直勾勾地看着沸兒，他認定沸兒是他的孩子，硬是要將沸兒搶走。喜蓮等人阻止了他，還要趕他出去。明心讓他在華佗靈前説句實話，天來到底在哪裏，可既便這樣，吳成還是昧着良心説自己不知道。這時甄依柳尋吳成過來，對明心和沸兒一番羞辱不説，還踢着華佗的棺木惡毒的咒罵。沸兒看不慣甄依柳對母親的無禮，上前替明心抱不平，甄依柳動手想打沸兒，吳成一掌一耳光打向甄依柳。甄依柳像潑婦一樣準備大鬧，這時曹操突然進來祭拜華佗，吳成趕緊帶着甄依柳倉皇而走。曹操拜完華佗準備離開時，突然發現一旁的靈兒。曹操盯着她欲言又止，這時下人來報曹衝病情反覆，曹操這才匆匆離去。吳成宴請胡半仙，在他巧舌如簧地勸説下，胡半仙考慮到華佗已死，明心母子的確無依無靠，再加上吳成賭咒發誓，胡半仙真的相信他會痛改前非，於是告訴了吳成沸兒的身世，沸兒果真是吳成的親生兒子。吳成激動的跪地拜天。回到家吳成極力地討好勸説甄依柳，哪知她死活都不鬆口。

吳成讓胡半仙把沸兒帶過來，他給沸兒買了一些吃的玩的，討好地哄沸兒開心，並告訴沸兒自己是他親爹。沸兒看着胡半仙，胡半仙點頭確認了吳成的話。沸兒小心翼翼地伸出手想接過吳成手裏的玩具，卻不料甄依柳突然衝出來，對着吳成一頓痛罵，還推搡着沸兒。吳成氣不過打了甄依柳一耳光，她便不依不饒，鬧的驚動了甄太醫。甄太醫又將吳成呵斥一通，還威脅要將他趕出太醫院。吳成不想好不容易得到的一切化為泡影，他再次選擇了仕途和富貴。沸兒失望地跟着胡半仙離開了。孩子那無辜可憐的眼神深深地刺痛了吳成的心。靈兒和明心跪守在華佗靈前，靈兒告訴明心自己自天來失蹤以來對天來的牽腸掛肚，她才意識到自己對天來的感情就是愛。這時胡半仙拉着沸兒回來了。眾人突然聽到棺材裏的響聲，以為有鬼，嚇的驚恐萬分。華佗這時從棺木裏爬出來，原來他是服用麻醉藥過量出現了假死。華佗摟着明心和沸兒喜極而泣。曹操聽説了華佗死而復生的事非常高興，親自上門請他為曹衝看病。曹操不再信任太醫院的人，於是華佗提出要讓自己的朋友一起親自為曹衝配藥。曹操包下華佗住的驛館。此時曹丕卻給吳成下令，讓他想辦法迅速醫死曹衝。吳成覺得很難下手，但曹丕卻給吳成下了死命令。吳成想到華佗那裏動手腳，但華佗的驛館卻被重兵把守。吳成被曹丕逼的走投無路，於是在街上拉着買菜的喜蓮，故意危言聳聽地告訴他曹丕想要曹衝的命，所以華佗要醫治好曹衝的命就會招來殺身之禍，他會對華佗心愛的人動手。喜蓮一下子擔心起明心的安危，吳成於是故做好人的提出，自己可以做一些治標難治本的藥交給喜蓮讓曹沖服下，然後他再另想他法。另一邊，他又安排曹丕的人故意跟蹤喜蓮，製造一種曹丕真的要嚮明心動手的假像。喜蓮果然上當，從吳成那裏取回來他説的那種藥，並找機會將藥下在胡半仙為曹衝碾制的藥裏。甄太醫通知天來明天會在丞相府中進行新晉太醫的典禮，曹操會親自參加和主持。天來終於等到這個時機，便霍霍磨刀準備明日刺殺曹操。在典禮上甄太醫極力推薦天來，説他過目不忘是難得一見的醫學奇才。吳成暗自得意地看着甄太醫。曹操要親自檢驗天來過目不忘的本事，要交給他一份卷宗讓他看後背誦。天來慢慢接近曹操，目露兇光，慢慢將手伸出袖中。曹丕深知吳成的計劃，看到時機成熟故意大喊捉拿刺客天來。於是曹兵皆認為甄太醫與天來是一夥的，於是將刀劍刺向甄太醫。甄太醫至死才恍然大悟這都是吳成的計策。曹丕想乘亂殺死天來，但曹操卻突然下令不得傷害天來，甚至在天來脅持曹丕時曹操仍然下令不得傷害天來。最後曹操向天來承諾絕不傷害他，放他走，天來才放開曹丕逃走。此次除掉了甄太醫吳成大快人心，曹丕承諾日後保吳成坐上醫丞之位。吳成對曹丕感恩戴德。此時曹操將曹丕招去，曹丕還想在父親面前表功，曹操卻一眼看出曹丕是有預謀地安排了這一切。因為他竟然事先在曹操身側安排了持刀劍的兵士，這讓曹操非常生氣。曹操把今日在曹操身側救駕的人，全部捆了起來，交給曹丕讓他一一處決。

曹丕知道這些都是自己的死士，但為了在曹操面前表忠心，他還是將這些人一一處死。不久吳成被任命為醫丞，昔日的甄府也被改換門庭成了吳府。甄依柳和侄兒小甄見甄太醫屍骨未寒就被吳成鳩佔鵲巢，恨的咬牙切齒。吳成這一下可是揚眉吐氣了，他理直氣壯地去驛館接沸兒回家，結果甄依柳聞訊又跑來大鬧，吳成對她毫不手軟地扇了她幾耳光，然後告訴她甄太醫就是自己害的，他忍氣吞聲了這麼多年現在終於翻身。甄依柳聽到這些如雷轟頂。吳成又來搶奪沸兒，華佗這時從屋裏出來阻止吳成，哪知沸兒突然説他就要吳成這種威風的爹，他不要華佗。眾人都愣住了。曹衝的病突然加重，華佗給曹衝檢查時發現他有中毒的症狀。因為曹衝的藥都是華佗安排的人經手的，如今他難辭其咎。胡半仙將這個消息告訴眾人，喜蓮嚇的魂不守舍，她沒有想到曹衝會中毒。喜蓮的表情落在胡半仙眼裏，在胡半仙的訊問下喜蓮告訴了胡半仙吳成欺騙自己所做的事。喜蓮決定承擔下所有的一切，只為救得華佗無事，明心有人照顧。胡半仙安慰她不要把事情説出去，一切由他來安排。華佗在檢驗曹衝藥渣裏的藥物時，因為藥被浸泡很多次，他沒有能力檢查出來，於是他請來了靈兒。靈兒天生異稟鼻子特別敏鋭，她檢查出藥裏果然有其他毒物。曹操看着靈兒的眼神別在深意。靈兒回到山林，她前些日子救了從曹操那裏逃脱出來的天來，並把他藏身在山林裏一個小屋裏。結果靈兒卻發現天來不見了。原來天來無意中看到一些人帶着弓箭，靈兒跟在他們身後，天來以為靈兒出賣自己，趕緊逃離。到了晚上才偶然聽到白天拿弓箭的人議論白天差一點逮住的梅花鹿被一個女孩故意嚇跑的事。天來才知道誤會了靈兒，他趕緊回到小屋，激動地把靈兒摟進懷裏。靈兒勸天來不要再刺殺曹操，但天來心意已決。靈兒見勸不下他，於是將她入曹府時觀察到的曹府的士兵換崗人數、時間以及曹府的房間位置詳細地寫了下來，她將此交給天來，還是勸他放棄刺曹。天天答應明晚再行動最後一次。曹操晚上把曹丕召進府裏，先是告訴他曹衝中毒但幸得華佗救治，又告訴他自己百年之後會位傳給他。曹丕受寵若驚，千恩萬謝地離開，走時曹操送給他一個小木盒裝的禮物。等曹丕走出房間打開木盒，才發現竟然是一盒藥渣。曹丕頓時明白自己所做的一切曹操都知道。曹丕嚇出一身冷汗。曹操突然派人將靈兒請到府上，眾人皆不知所以。途中只聽到眾人議論紛紛，都言曹丕給曹衝下毒，甚至連朝堂之上都這樣傳言。為平息這些傳言，曹操決定拿華佗當替罪羊。於是下令將華佗以投毒害曹衝之名抓了起來。

靈兒被帶到曹操面前後，看到曹操正對着一副仕女圖黯然神傷，圖中的女子與靈兒有幾分神似，她手上的五彩手鐲與靈兒手上的一模一樣。靈兒明白了眼前的這個人就是她的父親。曹操之前看到靈兒的長相早就生疑，他問靈兒的父母是哪裏人，靈兒不想認這個父親，於是謊稱自己的父親是獵户母親是繡娘，曹操很失落。靈兒離開後想到天來説了晚上要來行刺曹操，靈兒知道只要天來殺不了曹操就不會罷手，只有用曹家的血來還債才能平息天來的仇恨。於是靈兒將五彩鐲讓人交給曹操，曹操看到手鐲就明白了一切。靈兒向曹操提出兩個要求，一是告訴他曹衝之事與華佗無關，讓曹操不要亂殺無辜；二是靈兒提出以自己的命換天來的命，讓曹操放過天來。曹操還未反應過來，天來就從窗子裏跳進來刺殺曹操，曹操躲閃時靈兒卻主動迎上天來的劍，天來一劍刺穿了靈兒的腹部。天來看到誤殺了靈兒悲慟欲絕，曹操更是老淚縱橫。靈兒最後求曹操和天來恩怨就此了結，讓曹操不要殺天來，讓天來放下仇恨不要殺曹操。説完這一切靈兒閉上了眼睛。曹操把天來帶到自己的密室，那裏駭然有幾尊呂家一家的雕像和靈位，在他們面前還是一個是跪着的曹操的雕像。曹操告訴天來當年因為誤會失手殺了呂家一家老小的原因，並告訴天來這一直是他最痛苦的心理折磨，這些年他每次想到這件事都夜不能寐。當年他四處尋找天來不是為了殺他，而是想好好地保護他，延續呂家最後的血脈。如果不是為了天下蒼生，他願意以命抵命。他更是主動邀請天來到他的隊伍做監斬官，時時提醒他昔日犯下的過錯。喜蓮看到明心因華佗被抓走哭的死去活來的樣子，於是下了決心要去找曹操承擔過錯。胡半仙勸阻了喜蓮，他主動到曹操面前承認自己是因為嫉妒華佗的才華才故意陷害華佗。曹操知道胡半仙説的都是託辭，但毒害曹衝一事總得有人頂罪堵住悠悠之口。於是曹操準備當眾處決胡半仙。在胡半仙行刑前，明心帶着沸兒站在圍觀的人羣中，淚如雨下而又無能為力。劊子手舉起刀準備砍向胡半仙時，卻被人羣中有人叫停。只見喜蓮穿着一身紅嫁衣，提着一個裝酒的籃子，當着眾人的面宣佈自己要在刑場上與胡半仙舉行婚禮。胡半仙想勸阻喜蓮，但喜蓮卻心意已決。喜蓮將帶來的酒為自己和胡半仙各倒一杯，端給了胡半仙。胡半仙喝下酒後不久就和喜蓮一起口吐鮮血，眾人驚呼是毒酒。喜蓮和胡半仙雙雙倒地而亡。曹操厚葬了胡半仙夫婦，但華佗卻對兩人成了曹家內鬥的犧牲品而怨恨曹操。曹操搬出一大套為了百姓蒼生只能犧牲胡半仙等人的理論讓華佗根本不能接受。華佗失望地離開了。

天來向華佗辭行，他要去曹操軍營當監斬官，看看曹操是不是真如他自己所説是為天下蒼生，如果曹操不是如他自己所説，天來説一定會殺了他。此時大戰在際，曹操將與關羽對戰，華佗見之前一同喝酒的二人將要兵戎相見，他想和天來一起去曹營上戰場。明心讓他安心去，自己會回譙郡安定生活。此時小甄突然到訪，因為他力量單薄，找吳成復仇一事難上加難。於是想拉攏天來和華佗。天來本不想與小甄有任何來往，但小甄將吳成利用天來害死自己的父親，然後和曹丕勾結當上醫丞的事告訴了天來，天來想到自己就是因為仇恨矇蔽了雙眼才沒在發現吳成的陰謀，所以他不想再找吳成報仇。小甄見天來放棄報仇，於是轉身想拉攏華佗，華佗不想聽他挑撥，但小甄卻告訴了他華父死亡的真正原因。華佗沒想到吳成會做出這種禽獸不如的事，一時痛苦的不知如何發泄。小甄見華佗也沒有報仇的想法，悻悻離開。吳成這時又來搶沸兒，華佗抓起一把手術刀逼問吳成是不是害死了自己的父親。吳成巧舌如簧不承認。沸兒見狀衝上去拉華佗，讓他不要傷害自己的父親吳成。華佗終究沒有下的了手，放了吳成。他不是相信吳成，而是不願意相信吳成會做出那種遭天遣的事。大戰開始後，百姓因為疾病和飢餓民不聊生。曹操告訴眾將百姓如今食不果腹的情形皆因戰亂不斷，於是在兵糧緊張的情況下，力排眾議讓將士們將糧食施捨給百姓，並且從他自己和眾將士做起每日只食一餐。天來在軍帳中目睹了曹操的所作所為，內心非常震撼。心中對曹操有了新的認識。夏候勇因為對天來有看法，覺得他每天帶劍在曹操身邊，終是大患。曹操狠狠地批評了夏候勇。夏候勇不服，他見軍糧緊張，當他打聽到有一個村莊為關羽蜀軍供糧，於是突襲了村莊，血洗了一半村民搶到了糧食。曹操聽説夏候勇屠殺百姓的事後，不顧眾將士説情，依軍法將夏候勇處斬。因為華佗隨軍，明心母子留在譙郡，吳成天天騷擾明心，在明心和沸兒面前做戲裝樣，想千方百計地將他們母子帶到京城。最後他見明心意志堅定，於是説服沸兒跟他回京城。沸兒卻堅持明心不走他自己也不會走。

牛二在集市上鬥蛐蛐，牛二的黑頭將軍所向披靡，沸兒也擠在人羣中看熱鬧，此時有人出價一百錠銀子買他的黑頭將軍。人羣沸騰了，黑頭將軍受了驚嚇跳出蛐蛐罐，沸兒不小心正好踩在蛐蛐上，等他把腳拿開，蛐蛐已經死了。牛二訛上沸兒，要明心賠他一百錠銀子。正在爭執時吳成拿着銀子從人羣中走了出來，他稱沸兒是自己的孩子，自己願意為他賠償。明心堅持不要他的錢，將華佗的宅子抵押給了牛二。母子倆搬出華宅，吳成勸他們不如跟自己回京城，但明心拒絕了。牛二和吳成一起喝酒，牛二一直誇吳成有計謀，幫自己白白得到一個大宅子，而吳成將明心母子逼上絕路，害他們母子流離失所，他想借此機會將兒子奪回。明心帶着沸兒住進一個破廟，明心想帶着沸兒去找華佗，沸兒卻一直是想回到吳成那裏，他不顧外面下着大雨衝到外面，明心把他勸回房裏。半夜沸兒發起高燒，明心急的沒有辦法時吳成趕到。吳成勸明心帶沸兒跟他一起走，明心明確告訴他今生今世自己也不可能跟他有什麼交集，至於孩子等他成人後讓他自己選擇認不認吳成。關羽在曹操陣前與曹軍對陣時，被曹軍的弓箭射中。關羽撤回蜀軍後，曹軍大將告訴曹操關羽中的是毒箭，曹操雖覺勝之不武，但想到兩天後關羽就會毒發身亡，曹軍從此失去一個勁敵也未嘗不是件好事。華佗聽説了關羽中毒的事後找到曹操，提出要去蜀營為關羽醫治。曹操告訴他關羽中毒是故意放出的穩定軍心的消息，華佗相信了。曹操命人嚴密監視華佗防他逃到蜀軍軍營。關羽派人拿着令牌去曹營救華佗，夏侯勇的弟弟一心為兄弟報仇，主動在曹營中接應他們。他們故意裝着劫持華佗，夏侯將軍則讓其中一人故意裝着俘虜，借向曹操彙報的機會殺了曹操。曹操得知夏侯將軍來報於是在帳中見他。但曹操見俘虜衣衫整潔，腳上無泥，且捆綁處無淤傷，曹操頓時生疑。等夏侯勇出手時曹操已有防備。夏侯勇刺殺失敗後曹操卻令人放了他，並對他兄長的死表示遺憾，但為了夏侯家決定還是放他。夏侯將軍深感曹操的大義，主動臣服並坦白了蜀軍劫持華佗的事。曹操的士兵得信後及時阻止了華佗出營。關羽此次行動失敗，帳下屬下獻計讓關羽詐死，蜀軍軍營一時到處蒙上了白布，將士們也帶着白孝。曹軍的探子將此消息上報曹操，曹操雖失了勁敵，但他佩服關羽的大義，心中還是非常的難過。曹操帶華佗一起到關羽靈堂前祭拜，華佗提出想在關羽靈堂房設帳，白天看病，晚上替關羽守靈。曹操答應了。晚上，華佗獨自在靈堂外喝酒，想到與關羽的過往，華佗很感傷。突然靈堂的帆布被風吹開，華佗儼然看到了關羽的身影。

華佗進到帳中，驚見關羽正襟危坐在帳內。關羽告訴華佗形式危急迫不得已出此下策。華佗見關羽沒死喜出望外，於是準備為他做手術。這時關羽手下的將士周倉告訴華佗如果能有他家鄉的一味藥草千睡草就好了。華佗聽聞他説的這味草藥千睡草可以起到麻醉的作用非常感興趣，向周倉打聽詳情。關羽見華佗一副醫痴的樣子頓感好笑。關羽讓周倉擺好棋盤，讓周倉陪自己下棋，而華佗則在一旁為關羽做手術。華佗拿着手術刀為關羽剖開傷口，關羽疼的拿棋子的手都在發抖，而臉上卻沒有表露出來。這時屬下通報曹操派人來請華佗，稱曹操頭疾發作。華佗趕緊走出帳外，不讓來人發現關羽，然後跟隨來人趕緊趕去。周倉擔心華佗會出賣關羽，但關羽相信華佗的為人。曹操正在帳中疼的痛不欲生時，華佗及時趕到。華佗告訴曹操此番醫治得扎三針，每針間隔一柱香的時間。華佗為曹操紮了第一針後就要匆忙離開，他告訴曹操剛剛他才為一個傷兵切開了傷口，現在他必然回去接着醫治。曹操手下大將曹仁覺得華佗輕慢了曹操在些生氣，但曹操卻應允了。華佗匆匆趕回去，為關羽繼續醫治。一柱香時間到後，華佗只得又趕到曹操那裏。當華佗再次向曹操提出要去醫治傷兵時，多疑的曹操讓曹仁跟着去查看。結果當週倉看到帳外情形後，當機立斷地用刀劃傷了自己的胳膊。當華佗走到帳外時，讓曹仁等在帳外，哪知曹仁堅持要進去看看，華佗正為難時，周倉滿身是血的從帳裏出來，裝着生氣的樣子責怪華佗不該治療半途而廢。曹仁這才相信華佗的話。華佗最後返回醫治好關羽後，關羽感到傷口疼痛立止。關羽怕時間久了讓曹操生疑害了華佗，於是起身告辭。周倉想借此機會殺了曹操，但關羽制止了，覺得此時殺曹操只會連累華佗。曹操在帳中時見曹仁若有所思的樣子，問他時曹仁突然想起剛剛見到的傷兵面熟，是關羽的屬下。於是曹操急忙趕去找華佗，華佗直言剛剛就在帳內為關羽刮骨療傷。曹操大驚，命曹仁火速追趕。此時關羽和周倉正往回趕，他們突然發現隨行的周光不見了。原來周光不想放棄刺殺曹操的良機，堅持返回要行刺曹操。已混跡到曹操身邊的周光突然發難，華佗和天來見狀立刻掩護曹操。曹仁及時趕了回來，朝糾纏在一起的天來和周光同時放箭，天來中箭而死。華佗傷心地斥責曹操名為天下蒼生，實則連累害死了很多人。曹操下令厚葬天來。關羽單槍匹馬地來到曹營，曹操知他心意，命人打開營門併為關羽拿來一件喪服，供他一同祭拜天來。華佗身心疲憊不想再到任何一方的軍營，華佗求關羽善等蒼生，希望劉備、孫權和曹操三方勢力不要為一已私慾害了天下蒼生。隨後他想尋到麻醉藥的最後一味配藥後回到譙郡。吳成將明心和沸兒帶回京城，明心不願意住進吳府。吳府下人向吳成建議給明心一個名份，她才會答應住進來。吳成帶着甄依柳，甄依柳受吳成脅迫，跪在明心面前自願放棄正室，自願做小，求明心回吳府。甄依柳聲淚俱下的痛哭加上沸兒一心想跟吳成在一起，明心答應搬進吳府，但要住離吳成最遠的房間，也不願跟吳成同桌吃飯。因為甄依柳對沸兒不喜歡，惹得吳成大發雷霆，讓她從此後跟下人一起吃飯，不得再上飯桌，甚至有一次一天不給她飯吃。明心將沸兒多帶的飯菜給一天沒有吃飯的甄依柳，甄依柳還是充滿敵意，明心告訴人心最難做到的是寬恕，她從來沒有對甄依柳有任何的仇恨。甄依柳感動的熱淚盈眶。

吳成聽下人彙報，偷聽到甄依柳和明心的談話，稱她們兩人已結為姐妹，而且明心還要帶着沸兒回譙郡等華佗。吳成勃然大怒，將甄依柳暴打一頓。甄依柳現在活的連個乞丐都不如，哭的死去活來。小甄從丫鬟娟兒口中得知姑姑的慘狀，一心想幫姑姑出氣為父親報仇。於是他假裝對吳成低聲下氣，請吳成喝酒。他將吳成灌醉後偷偷地和甄依柳把吳成拖進存藥屋，然後想放火燒死吳成。結果明心聞到煙味尋過來聽到他們的計謀，勸他們不要因為殺了吳成被官府追殺賠了性命。甄依柳本就唸在夫妻一場下不了手，明心一勸她就打算放棄了。吳成早上醒來發現了手上有木炭的痕跡，心中生疑。甄依柳被懷疑嚇的要死，明心幫她解了圍。哪知沸兒説漏了嘴，吳成知道了甄依柳和小甄的陰謀，便將甄依柳綁起來用鞭子抽用烙鐵燙。明心得知消息帶着沸兒趕了過來，沸兒看到吳成烙鐵烙甄依柳的恐怖血腥的場面嚇的昏了過去。沸兒醒來後心有餘悸，明心提出帶他逃離時沸兒一口答應了。哪知剛逃到門口就被吳成帶人堵住，吳成將沸兒搶了回去將明心關在門外。沸兒現在看到吳成猶如見到惡魔，吳成見他如此吵鬧就把他關進地窖。甄依柳知道了此事求娟兒在吳成飯菜裏下蒙汗藥，麻翻吳成後甄依柳偷到地窖的鑰匙放出了沸兒。甄依柳將沸兒交到明心手裏，讓他們快點逃走，明心勸她跟自己一起走，她説要帶着娟兒一起走，她還要收拾一些細軟。結果她在屋裏收拾細軟和值錢的東西耽誤了時間。家丁發現沸兒不見後，急忙叫醒昏迷不醒的吳成向他彙報。吳成氣的把所有的怨氣都發泄到甄依柳身上，他拔下甄依柳頭上的髮簪刺瞎了甄依柳的眼睛。然後將瞎眼的甄依柳趕出家門，甄依柳淪為了乞丐沿街乞討。明心在沸兒的帶領下，想回到譙郡等華佗。因為華府被牛二霸佔，明心只得帶着沸兒住到附近的破廟。華佗回到譙郡，得知華府被牛二霸佔的原因，又打聽到明心母子住在破廟，於是便去尋找他們。明心聽到華佗的聲音悲喜交加，沸兒卻很不高興住在這麼破的地方。華佗正安慰沸兒時，眾鄉親感念華佗平時免費給他們看過病送過藥，都自發地趕來為他們送來了被子和其它生活必需品。華佗也很感動，請鄉親們幫忙在破廟外搭一間草屋。

華佗在破廟安頓下來後，在院子裏種了很多千睡草。吳成三番兩次地來騷擾明心母子，沸兒也不滿現在清苦的生活，覺得是華佗破壞他們一家三口，造成他們一家三口不能在一起。沸兒對華佗充滿敵意。華佗知道吳成來騷擾明心就是對麻醉藥的配方不死心。他把最後一味藥引子千睡草給了吳成，讓他不要再騷擾明心。同時華佗還希望吳成把曼陀羅的劑量告訴他，他希望早一點研究出麻醉藥配方。吳成卻心存私心，不願告訴華佗，他要讓華佗多走一些彎路自己去琢磨。譙郡來了很多西域人。他們聽説譙郡的藥材好特意來收購的。西域人聽聞華佗大名，願意高價聘請華佗幫他們收藥鑑別藥材好壞。華佗很願意幫助他們。哪知剛問了一個藥店，牛二的人就出來搗亂。他們要強徵這些藥材。藥農們懼怕牛二，不敢跟他説理。華佗勇敢地站出來，公開挑釁牛二，還要上報官府。牛二在吳成的授意下又想出一計。西域人臨走時把買藥的銀兩都交給了華佗。華佗送別他們回來時，突然發現銀兩都不翼而飛。牛二這時過來了，幸災樂禍地慫勇藥農向華佗要錢，華佗很尷尬，承諾寬限幾日他想辦法把那些錢還給藥農。沸兒看到這些人都來欺負華佗，於是當面告訴大家，是吳成讓他把錢藏起來，然後陷害華佗。眾人都很詫異，半信半疑地跟着沸兒到了院子裏，原來他真的把錢藏在院子裏的一個籃子裏。華佗想到一個奪回華府的計謀。他帶着沸兒乘牛二在樹下打盹時，悄悄地將一隻地蜥子放到牛二的褲管處，然後他們就躲在不遠處。一會兒地蜥子順着褲管爬進牛二衣服裏，牛二一陣手忙腳亂地找尋後抓到地蜥子並將它踩死。華佗和沸兒假裝尋找東西，説他們有三隻地蜥子不見了，華佗利用牛二有臆想症的毛病，故意説地蜥子會鑽入人的肚子裏，讓牛二小心一些。這句話讓牛二生了心病。他三天沒有吃喝，他怕自己吃飯後反而喂大肚子裏的地蜥子，於是強忍着飢餓。結果他越發產生臆想，覺得家裏到處爬的都是地蜥子。牛二快崩潰了。牛二由家丁扶着找到華佗，華佗危言聳聽地説牛二肚子裏的地蜥子是母的，説不定會生子。牛二嚇壞了。華佗乘機説只有還回自己的房子才會為他看病。牛二隻得把房子還給華佗，華佗裝模作樣地故意為他診治，最後叮囑他只有多做善事才可能逃過劫。華佗帶着明心和沸兒歡天喜地地搬回了華府。

明心給華佗做好粥，讓沸兒給華佗端去。沸兒對華佗還是沒有好感，但不能違背明心的意思，只得不高興地從廚房往前廳端去。牛二此時正在前廳向華佗訴苦，説他想做善事，但不敢得罪吳成。在華佗的追問下，牛二一咬牙把吳成曾指使他做的壞事都告訴了華佗。他説了逗蛐蛐騙沸兒逼的明心母子流落破廟的事，又説了當年太醫院選藥時他以次從好害死那麼多人的事，還説了西域人買藥他從中搗鬼想陷害華佗的事等等。沸兒此時正好走到門口，他才知道原來自己的爹那麼壞，對他們母子也下的去手。沸兒扔下端來的粥哭着跑了。華佗聽到動靜追了出去。華佗安慰沸兒，沸兒的心漸漸平靜下來。此後他不再念叨想跟吳成回京城，而是一心跟着華佗學書法、採草藥、學五禽戲。沸兒和華佗的感情越來越深。一日，沸兒好奇地問華佗為什麼要給豬扎針，難道他也像爹吳成一樣心狠手辣喜歡虐待嗎。華佗跟他解釋自己是為了提高醫術，研究麻醉藥醫治更多的天下蒼生，也醫治他母親的眼睛。沸兒同時也知道了華佗為什麼還在他自己身上扎針。沸兒小小的心裏對華佗充滿敬意。華佗要研究曼陀羅在人體的劑量。他讓沸兒守着他，如果他食用曼陀羅後半個時辰不醒，就讓沸兒幫他叫大夫。沸兒看到華佗捨己為人地以身犯險試藥，為了讓母親的眼睛早點好起來，他也想幫幫華佗。他悄悄地拿走華佗的曼陀羅果實，躲在郊外試吃。結果華佗發現自己研究的曼陀羅果實丟失後正納悶時，明心過來告訴他沸兒不見了。他們正準備出去尋找時，有鄉鄰抱着沸兒回來了。沸兒嘴唇發黑昏昏欲睡。華佗趕緊檢查，發現已經晚了。經詢問才得知沸兒看華佗為明心試藥也想幫忙，他也偷偷地拿曼陀羅果實試吃。他奄奄一息但是很高興地告訴明心，經過他試吃發現曼陀羅一點也不苦，讓明心放心。明心看到沸兒雖然不懂事但這麼孝順，早已經哭的傷心欲絕。沸兒有氣無力地告訴明心自己一直想看十五的花燈，但估計等不到了。華佗馬上把沸兒放在板車上推着他到了街上。眾鄉親配合地拿着各式花燈模擬着十五那天的燈會，天空中又放着各色煙花。沸兒幸福地看着這一切，滿意地閉上了眼睛。明心哭的撕心裂肺。回到家中，華佗猶豫再三向明心提出想打開沸兒的身體研究藥理反應，明心不能接受。華佗陳明大義，明心經過心裏鬥爭最終忍痛答應了。隔天華佗在家裏設置了沸兒的靈堂，眾鄉親自發地前來弔唁。吳成怒氣衝衝地過來指責華佗害死自己的兒子，説這是華佗在向自己報復。明心痛斥他如果不是他的私心不願告訴華佗曼陀羅的劑量，華佗不會做研究，沸兒也不會誤食而死。他才是害死沸兒的元兇。吳成愣住了。接着他又要搶奪沸兒的屍身，説不能讓沸兒做孤魂野鬼。牛二此時也站出來阻止吳成，説他如果再胡鬧就把他當年以次從好換假藥的事告訴眾鄉親，看他還能走不走的出譙郡。吳成退卻了。華佗拉着明心跪拜在華家列祖列宗面前，説要把沸兒歸入華家人裏面。吳成憤然地看着這一切。

華佗在列祖列宗面前祭拜後，拉着明心走到眾鄉親面前，讓大家作證沸兒從此再與吳成無任何瓜葛，而是他華家的子孫。牛二此時代表眾鄉親告訴華佗，因為眾人這些年來基本都受過華佗的醫治，感念他的恩情，都承認沸兒為華家人。吳成佔不到便宜，指着華佗和牛二等人，出言威脅他們日後他一定加倍奉還。吳成懷着滿腔的仇恨憤然離去。吳成和華佗分開後各自獨立研究麻醉藥。吳成按照華佗以前的配方始終不得要領，他異常惱怒；而華佗親自試藥多次試驗終於有所成。他激動地把研究成功的麻沸散交到明心手裏，並把這個令人振奮的消息告訴了她。明心也發自內心地替他高興，她稱華佗終於完成了他的心願。華佗卻告訴她自己還有一個心願，就是把自己的見聞和醫術寫在青囊中，以後彙集整理成一本書，傳給後人，讓自己的醫術能夠廣為流傳造福更多的天下蒼生。明心沒有想到華佗有這種更宏大的志願，她建議此書就起名為《青囊經》。華佗覺得有了《青囊經》、麻沸散和五禽戲，此生足矣。華佗想用麻沸散給明心做手術。但他心中十分忐忑，他一個人面對華父的靈位訴説心中的擔憂和徨恐，他怕萬一有個閃失會失去明心。明心聽到他的傾訴，拉着華佗到了娘娘廟要與他當着女媧娘娘的面結為夫婦。華佗很激動，怕這樣簡陋對不起明心。明心告訴他，自己相信他，願意讓他做手術，但為了防萬一給自己留下遺憾，所以她想在這之前與華佗成親。華佗感到明心對自己的情深意重非常感動。兩人讓娘娘廟的女媧娘娘為證結為百年之好。兩人佈置了洞房。晚上，紅燭搖曳，這一對苦命的鴛鴦終成眷侶。次日，華佗將麻沸散端給明心喝。明心表現的比華佗還要淡定和勇敢，她要讓華佗沒有顧慮和擔心。手術進行的很成功，明心也從昏睡中醒了過來。華佗告訴她七天後她將重見光明。華佗將研製成功麻沸散的消息告訴了眾鄉親，讓他們以後有病都可以找他來看。眾鄉親感激不盡，有了華佗和他研製的麻沸散真是為大家造了福。曹操的頭痛病發作，疼的死去活來。他讓人快馬加鞭地趕到譙郡讓華佗火速到京城為他醫治。華佗稱自己妻子手術後尚未痊癒，不會到京城，請曹操見諒。來人只得回去如實稟報。此時吳成暫時緩解了曹操的疼痛，曹操聽聞華佗為妻子不來給自己醫治倒也能夠理解。吳成乘機挑撥離間説華佗將一民婦看的比魏王曹操還要重。結果曹操反誇他一句為表忠心把兄弟都拿來出賣。吳成聞言非常尷尬。東吳孫權主動向曹操稱臣，信使帶來的信中還勸曹操取代漢室稱帝。曹操當着眾人的面稱自己今生不會主動稱帝。曹操與羣臣正商議時事時，頭疼再次發作，眾臣看到曹操痛不欲生的樣子頓時亂作一團。

因為曹操的頭痛此次發作非常厲害，華佗和明心被接到京城。華佗將明心安置在客棧，一個人到丞相府給曹操看病。經華佗仔細檢查，他告訴曹操他的頭風已侵入骨髓，現在的醫治方法是開顱切除病灶。眾太醫皆驚呼，覺得他大言不慚，存心要害死曹操。華佗平靜地告訴曹操，自己已經把麻沸散研製成功，且已經為明心做了手術。曹操命下人試服麻沸散，下人服下後迅速昏迷，無論華佗用髮簪怎麼刺激他都沒有醒來也不會覺得疼。曹丕甚至拔劍斬斷下人的手腕他也沒有醒來。吳成上前為下人號脈驚呼下人死亡。華佗説那是服藥後的正常反應。曹操疑心頓起，他覺得華佗是想借此機會害死自己為關羽報仇。曹丕就盼着曹操早死後自己接位，他早就視華佗為眼中釘。於是他借曹操發怒疑心之機，命人將華佗關進死牢。吳成到客棧找明心把華佗入監次日要處斬的消息告訴她，他就是要看到明心痛苦着急的樣子，那樣他才有報復的快感。明心聞言果然心急如焚，她杵着枴杖一路慢慢向大牢尋去，她想去看看華佗。此時華佗正向獄卒説情，他怕自己此次難逃此劫，他請求獄卒將他的手術刀和《青囊經》交給客棧裏的明心，他怕自己如果真的死了那本能造福蒼生的醫書失傳。獄卒敬佩華佗為天下蒼生的大義，答應了下來。哪知等他去找明心時，明心已外出去尋大牢了。獄卒只得把書帶回家。結果他的妻子見他帶回來死囚的物品怕招來禍事，一把就將《青囊經》塞到灶裏，等獄卒去搶奪時書已燒燬了半部。曹操此時疼的在牀上翻滾，曹丕和吳成在一旁看的乾着急。曹操讓下人給自己拿酒，想借酒暫時麻醉自己的痛感。曹操在醉酒後一時氣憤脱口而出要殺了華佗。曹丕乘機下達命令次日處死華佗。明心尋了一天好不容易尋到死牢，門口的看守卻無論如何也不讓她進去探望，説是曹丕專門交待不得探視。明心正無助地哀求時，為華佗傳訊的獄卒也找到這裏，他把明心拉到一旁，把她帶到了華佗牢房的外牆處，讓他們能夠隔着牆説上話。明心在牆外聽到華佗的聲音心如刀割，華佗温和地勸她安慰她。兩人説了一會兒話後，吳成突然到牢房探視華佗。他告訴華佗，華父是他殺的，連惠娘肚子裏的孩子也是他殺的，華佗害死沸兒他卻害死了華父和華佗與惠孃的孩子，自己還賺了一條人命。吳成喪心病狂地陳述這些年他做的壞事，害的人命，他就想引起華佗的仇恨，想讓他跟自己一樣生活在仇恨之中。明心在牆外聽到吳成的話，沒想到吳成會惡毒至此。吳成説完沒有看到華佗氣急敗壞痛不欲生的樣子，華佗反而很超然地告訴他自己不會恨他，只會可憐他同情他，因為他已經眾叛親離，他心中只有仇恨沒有愛。反而華佗自己充滿對天下蒼生的愛，對明心的愛，對自己的親人朋友兄弟的愛。吳成氣的要發瘋。華佗最後告訴他，如果明天自己要被處決，希望吳成能放下仇恨重新做人。吳成崩潰了。

曹操又開始頭疼時，下人給他送來茶水，他突然認出端盆的下人正是那天試麻沸散的人，他被曹丕砍斷的手腕綁着繃帶還在滲血。曹操見他安然無恙才知道錯怪了華佗。這時有下人來報説曹衝病危。曹操連忙趕去，曹衝已奄奄一息。曹操命人趕緊傳華佗，一旁的吳成告訴曹操華佗已死。曹操大怒，痛斥曹丕乘自己酒後亂言假傳命令，下令要將曹丕處決。小甄作為太醫一直站在一旁，此時他突然站出來為曹丕説情，説他都是受了吳成的矇蔽。他痛斥吳成是個卑鄙的小人。他説吳成把天來暗插在父親身邊，以致害死父親同時置曹操當時處於危險境地。吳成巧言令色百般狡辯，小甄頓時啞口無言。哪知曹操之前從天來那裏已經得知了詳情，知道小甄所言非虛，他怒斥吳成要殺了他。吳成走到窮途末路向曹丕求救，曹丕如今自身難保趕忙與吳成撇清關係。吳成被侍衞拖了出去。此時華佗已被拖至刑場，在路上他遇到了雙目失明行乞的甄依柳。華佗為了給她生的希望，謊稱自己要陪魏王出征，等他回來幫她治好眼睛。甄依柳頓時燃起新的希望。吳成在被拖到刑場的路上，眾太醫向路人陳述吳成的罪行，太醫們和路人紛紛向吳成投菜葉和雜物，吳成如過街老鼠一般。刑場上，華佗和吳成這一對冤家相遇，真是事事難料，他們最後竟然還結伴而行。眾鄉親自發地到刑場集體跪地向行刑官求情，讓他幫華佗説情。獄卒帶着明心趕到，在眾人的哀求下，監斬官允許華佗為明心拆下眼上的紗布。明心重見光明，但華佗卻即將被處斬。兩人好不容易盼到的幸福轉瞬即逝。這時獄卒跪地向華佗認錯，他沒有保管好《青囊經》以致只剩半部。華佗坦言，只要心存一顆治病救人之心，這尚存的半部經書足矣。接着華佗曾幫助過的鐵匠以及在曹操營中救過的大寶，他們和獄卒一起三人齊刷刷地跪地向華佗表示願意拜他為師學習他的仁心仁術。華佗甚感欣慰。而跪在華佗旁邊的吳成沒有一個人為他送行。這時甄依柳從人羣中擠出來，她抱着一罈酒來為吳成送行。她恨吳成，可同時她在名義上還是吳成的妻子。她的仁義之舉終於讓吳成流下了悔恨的淚水。明心扶持着甄依柳，讓她和自己一起好好地活下去。吳成直到最後一刻才認識到自己的錯誤，才感慨自己機關算盡壞事做盡得到的一切都成了過眼雲煙，到現在自己回到起點一無所有。他希望華佗死後見到惠娘能幫自己説一聲對不起。華佗含笑看着吳成，雖然他們都將走到生命終點，但最後一刻吳成能悔過他也覺得善莫大焉。此時，時辰已到行刑官宣佈行刑。曹操在此後的太醫甄選時告誡新晉的太醫們，醫術很重要，醫德卻更重要，只有心懷天下蒼生，將患者看作自己的父母兄弟姐妹或兒女，才會在醫治患者時有眾生平等之心。眾太醫受益匪淺。華佗臨刑前收下的幾個徒弟果然如他們所言，潛心學醫，懸壺濟世，造福四方蒼生。一日，一醫者揹着行囊在路上行走，看背影似是過去四處遊歷行醫的華佗。等他回過頭來竟然真的是須發皆白的“平生只有兩行淚，半為蒼生半美人”的華佗。