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化學信息學
(武漢理工大學建設的慕課)
鎖定
- 中文名
- 化學信息學
- 授課平台
- 中國大學MOOC
- 類 別
- 慕課
- 首開時間
- 2018年4月20日
- 建設院校
- 武漢理工大學
- 授課教師
- 林亞維、郭麗萍、胡曉松、袁泉
化學信息學課程性質
化學信息學課程定位
化學信息學是一門應用信息學方法及技術解決化學問題的學科,在社會信息化程度和技術飛速發展的21世紀,其重要性顯得尤為突出。化學信息學涉及化學、計算機科學、信息學等多學科交叉,內容龐雜且含有大量計算機軟件操作,因此適合利用慕課方式進行學習
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化學信息學適應對象
化學信息學課程簡介
化學信息學課程從實用性出發,針對貫穿於化學學習和研究的三個環節:化學信息的獲取、化學信息的分析加工以及化學信息的創造與傳播,設計了教學內容。它們均來自於化學及其相關學科的實際需求,把中國國內外網絡數據資源、科學應用軟件以及文獻信息使用規範與方法介紹給學習者,具體包括:中國知網與SciFinder數據庫檢索、NIST等化學事實數據檢索、專利文獻檢索與申請、文獻檢索與管理軟件Endnote、化學繪圖軟件ChemOffice(ChemDraw與Chem3D)、數據處理與繪圖軟件Origin、Matlab軟件(線性、非線性擬合;統計分析;定量構效關係(QSAR))、圖片編輯軟件Photoshop、矢量圖繪製軟件Adobe Illustrator、巧用word撰寫學位論文
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此外,課程還附有拓展資源的介紹:MestReNova介紹與使用、GuassView和Guassian構建分子模型和結構優化、Origin繪製cpcv曲線繪製、三維繪圖(3dmax,Cinema 4D繪製材料三維圖案)、Materialstudio建模、jade與searchmatch 的使用、SIMAC與SPSS
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化學信息學課程共8章,第一章掌握化學信息學概念;瞭解重要化學信息類型與來源;第二章掌握重要中外文化學文獻數據庫及其使用方法;瞭解重要文摘數據庫及其使用方法;瞭解重要特種文獻數據庫及其使用方法;第三章瞭解化學信息檢索幾種基本方法;理解化學研究中文獻引用規範;掌握文獻管理軟件Endnote軟件使用方法;第四章瞭解化學結構可視化軟件;掌握ChemBioDraw的化學結構繪製;掌握ChemBio3D進行分子三維展示、分子建模與簡單計算;第五章瞭解科學數據處理軟件類型;掌握Origin軟件基本用法;第六章瞭解MatLab軟件使用界面與基本功能;掌握MatLab軟件基本用法;第七章瞭解科技繪圖基本要求;掌握Photoshop基本圖片處理功能;第八章掌握利用word進行學位論文排版的方法;瞭解重要化學譜圖軟件
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化學信息學課程大綱
01課程導論 1.1 緒論 1.2 網絡化學資源 1.3化學軟件資源 討論 拓展資源 單元作業 單元測驗 02化學文獻數據庫 2.1 中文文獻數據庫(中國知網) 2.2 外文全文數據庫(ScienceDirect) 2.3 外文文摘數據庫的介紹與使用(SciFinder) 2.4 特種文獻數據庫(NIST) 討論 拓展資源(Google Chrome, Xmol, Web of Science, Pubmed,中國知網) 單元測試 單元作業 03文獻檢索與管理 3.1 化學外文文獻信息檢索 3.2 文獻管理軟件 Endnote 的介紹與使用 討論 拓展資源(Endnote) 單元測試 單元作業 04化學軟件ChemBioOffice 4.1 ChemBioDraw簡介 4.2 ChemBioDraw基本繪製功能 4.3 ChemBioDraw操作實例 4.4 計算化學簡介 4.5 ChemBio3D簡介 4.6 ChemBio3D分子建模 4.7 ChemBio3D計算功能 討論 拓展資源(ChemDraw實例,GaussView與Gaussian使用,materialsstudio使用) 單元測驗 單元作業 | 05科學數據處理軟件Origin 5.1 Origin軟件簡介 5.2 Origin操作界面簡介 5.3 Origin線性擬合 5.4 Origin數據導入 5.5Origin圖形繪製與格式調整 5.6Origin瀑布圖與雙Y軸圖 5.7Origin組圖繪製 5.8Origin選擇區域擬合 5.9Origin非線性擬合與分峯擬合 單元作業 拓展資源(origin繪製CP、CV曲線,) 討論 06MatLab軟件介紹與使用 6.1MatLab-nlinfit函數的語法與線性擬合效果評價 6.2MatLab-非線性擬合與過擬合 6.3MatLab-定量構效關係與受體-配體打分函數的建立 6.4MatLab-交叉驗證法與藥物先導化合物的篩選 07圖片處理軟件 7.1 科技作圖基本要求 7.2PhotoShop軟件介紹 7.3PhotoShop軟件基本功能 7.4利用PS繪製材料組圖 7.5利用PS繪製細胞膜模型 拓展資源(3dmax,Cinema 4D繪製材料三維圖形) 討論 單元作業 08巧用word進行學位論文排版與其他化學軟件 8.1巧用word進行學位論文排版 8.2 核磁共振軟件ACD/NMR Processor的介紹和使用方法 8.3XRD軟件Crystallographical Search-Match(CSM)介紹 拓展資源(jade,materialsstudio應用實例,電化學工作站CS軟件應用實例) 討論 單元作業 |
化學信息學開課信息
課次數 | 開課時間 | 授課老師 | 學時安排 | 參與人數 |
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第1次開課 | 2018年04月20日-2018年06月30日 | 林亞維、郭麗萍、胡曉松、袁泉 | 4小時每週 | 1445 |
第2次開課 | 2018年09月17日-2018年12月31日 | 1-5小時每週 | 1262 | |
第3次開課 | 2019年09月13日-2019年12月31日 | 3-5小時每週 | 8966 | |
第4次開課 | 2021年03月20日-2022年01月31日 | 3-5小時每週 | 2442 | |
化學信息學課程特色
化學信息學教學目標
1、瞭解化學信息學的基本概念;
2、掌握通過網絡查找和收集化學信息的技能
3、掌握現代重要化學圖文數據處理軟件的使用技術;
化學信息學學習預備
化學信息學預備知識
化學信息學學習資料
書名 | 作者 | 出版時間 | 出版社 | ISBN |
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《化學信息學》 | 林亞維,胡曉松,鄭錚 | 2019年10月 | 化學工業出版社 | 9787122349255 |
書名 | 作者 | 出版時間 | 出版社 | ISBN |
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《化學信息學(第三版)》 | 邵學廣,蔡文生 | 2013年3月 | 科學出版社 | 9787030369048 |
《ChemOffice2008實用教程》 | 曾煒,孫延輝,李紅霞 | 2009年 | 化學工業出版社 | 9787122-064097 |
《Origin實用教程(7.5版)》 | 周劍平 | 2007年 | 西安交通大學出版社 | 9787560524436 |
《化學軟件及其應用》 | 李夢龍,王智猛,姜林,劉麗霞 | 2004年11月 | 化學工業出版社 | 75025-59981 |
化學信息學教師簡介
- 參考資料
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- 1. 化學信息學 第1次開課 .中國大學MOOC[引用日期2023-01-06]
- 2. 化學信息學 第4次開課 .中國大學MOOC[引用日期2023-01-06]
- 3. 林亞維 .武漢理工大學化學化工與生命科學學院[引用日期2023-01-06]
- 4. 胡曉松 .武漢理工大學化學化工與生命科學學院[引用日期2023-01-06]
- 5. 袁泉 .武漢理工大學化學化工與生命科學學院[引用日期2023-01-06]
- 6. 李曦 .武漢理工大學化學化工與生命科學學院[引用日期2023-01-06]