全金屬狂潮

　　成功地解救出被綁架的少女後，相良宗介小隊接受了一項新任務：保護一名叫千鳥要的少女，據説克格勃及其他組織想要綁架她。

轉學到小要所在的陣代高中後，宗介發現出身伍行的自己似乎很難適應日本的高中生活。先是老師檢查他的隨身物品時找出了真槍，在做自我介紹時，宗介報出的阿富汗、黎巴嫩、及安哥拉等地名把同學們嚇了一大跳。接下來宗介更是突然闖入了女子壘球隊的更衣室……

　　訓練有素的宗介以軍人的警覺保護着小要，然而他的過度緊張造成了不小的麻煩。不過，由於宗介的英勇表現，小要也漸漸的注意到了這個怪人的存在，對他的看法似乎有了一點變化。

某天同組織的克魯茲駕駛着AS走在街上，由於開動了ECS電子迷彩，用肉眼是無法觀察到它的，但是一名鬍子拉渣面目兇惡的大叔卻將口香糖粘在了AS的腳上，克魯茲恍然大悟，意識到此人與要綁架千鳥要的組織有關。

　　夜裏有人鬼鬼祟祟地爬上小要家的陽台，梅麗莎、克魯茲和宗介三人頓時蹦了起來—— 一直等了這麼久，想要綁架目標的人終於出現了。

此時，秘銀的精鋭潛水艇“丹努之子”號得到了情報，用巡航導彈摧毀了蘇聯設在符拉迪沃斯託克附近的秘密研究機構，所有的資料都消失在熊熊烈火中。看起來，對小要的保護也將宣告結束了。

　　陣代高中組織學生前往沖繩進行修學旅行，但是神秘人物九龍劫持了宗介的千鳥要芽所在班級乘坐的飛機，將他們帶到了順安，並準備在研究出小要身上的特殊能力後將所有的學生連同飛機一起炸燬。

宗介救下差點被殺死的老師，很快他認出九龍是自己過去在阿富汗狙殺的恐怖份子，他怎麼也想不到為什麼這人還能夠活着出現在自己面前。

　　泰莎和加里寧安排了一個能救出所有人的計劃，於是梅麗莎和克魯茲駕駛着AS為先鋒，然後Mithril的精鋭部隊強行空降，將機場完全控制後運走所有的人質。

此時宗介救出了小要，並搶走了一台蘇制AS逃出基地，然而九龍駕駛着新型AS截下了他們並打傷了宗介，幸好此時克魯茲趕到，不過，在敵人先進的武器面前，克魯茲陷入了苦戰。

　　九龍的AS“科達爾”開動了強大的λ系統，克魯茲的武器根本無法將其打穿，最後在幾乎零距離的搏鬥中，克魯茲的AS被打成了碎片。宗介、小要找到了身受重傷的克魯茲，三人艱難的在森林中穿行，希望能到達海邊與潛艇回合。

小要忽然發生了變化，她身上隱藏的“黑科技”突然覺醒，令她幾乎陷入狂暴。此時興凱湖的軍隊包圍了他們，危急時刻泰莎將新型AS“強弩兵”（ARBALEST）送到他們身邊。

　　宗介駕駛着“強弩兵”消滅了敵人，與九龍的銀色AS展開決鬥。戰鬥中雙方都開動了λ系統，之前對此並不瞭解的宗介不禁大吃一驚。但是宗無法將新武器的全部實力發揮出來，在“科爾達”的步步緊逼下幾乎陷入絕境。此時小要腦中的黑科技再次覺醒，她用對講機告訴宗介使用意念來操縱λ系統，在她的指揮下，宗介啓動了λ系統的全部力量，一舉打倒了九龍。

回到學校後，本以為就此與宗介永別的小要，意外的發現他就在病房門口。

　　小要被一名叫白井的男生纏上，宗介以為這位倒黴的追求者要傷害小要 ，自然是將他關在廁所裏一陣毒打，不過暗戀白井的女生瑞樹非常傷心，一直怪罪小要搶走了自己的男朋友。由於怕丟面子她強迫宗介假扮自己男朋友，以應付好友的追問。

經過瑞樹的打扮，整天板着張撲克臉的宗介搖身一變成了一個着裝前衞的大男孩，被推到了瑞樹的朋友面前。

騙局最後被拆穿，瑞樹的初吻被糊里糊塗的宗介奪走，只因他把接吻當成了自己曾經在戰場上做過很多次的人工呼吸。

　　東京成田機場抓獲了一名入境少年卓間，他很可能是A21恐怖組織進行λ系統的研究相關“耳語者”。為此泰莎來到東京，但是在研究所遭到A21組織的突襲，保安人員在敵人的重型裝備攻擊下被橫掃一空，加里寧也因為保護泰莎而身受重傷，被A21恐怖組織的駕駛員莎拉俘獲。

由於宗介的不解人意，小要把他大罵了一通。回到家中，宗介赫然發現司令泰莎帶着卓間躲在自己家裏。此時來找宗介道歉的小要破門而入。

　　卓間的手臂裝有發報機，被小要用微波爐摧毀。為避免敵人的跟蹤，宗介等人躲到陣代高中，卓間偷出小要的手機通知了自己的所在地，泰莎和小要被A21的人抓走，以逼迫宗介交出卓間。交換人質時宗介要求對方先放走泰莎，引起她的不滿，但是隨後雙方便發生了激烈的戰鬥，兩位女孩再次被抓走，宗介則生死不明。

　　梅麗莎和克魯茲找到了大難不死的宗介，大家偷了一輛小貨車趕往碼頭。

三人衝破了當地警方的包圍來到貨船裏，此時卓間回到了姐姐莎拉身邊，為了得到姐姐的認同，在混戰中負傷的他坐上了巨大的AS“Behemoth”，超乎想象的龐然大物一把將梅麗莎的AS像玩具一樣捏在手裏，所有人都被這恐怖的景象嚇呆了。

　　卓間駕駛着“Behemoth”在街頭瘋狂的追殺宗介等人，雖然克魯茲用高超的槍法打傷了它，但卓間卻變的更加狂暴，誓要將他們踩成肉餅。泰莎緊急調用巡航導彈運輸“強弩兵”到宗介身邊，此時小要的能力再次覺醒，她指引宗介攻擊behemoth的薄弱關節將其打倒。戰鬥結束後，泰莎忽然説出自己喜歡宗介的驚人話語。

　　某天梅麗莎和泰莎爭吵起來，兩人決定用AS進行決鬥來證明自己的實力，而輸掉的人，就要 繞基地裸奔一週。男人們頓時為之沸騰。

泰莎找來宗介當教練，但缺乏運動神經的她常常摔個屁股朝天。於是她決定用計謀對抗戰鬥專家梅麗莎，果然僥倖取勝，然而作為賭注的裸奔卻。

　　風間信二的父親是一名AS部隊的指揮官，該部隊在與兄弟部隊的AS比武中總是敗北，使得士氣十分低落，信二也因此對父親失去了信心。

宗介隱瞞身份幫助風間小隊參加了比賽，與此同時對方的一名英俊軍官盯上了小要千鳥要，雙方全力以赴，最後熟悉對方機體的風間大叔與其小隊取得了勝利。

　　梅麗莎等人來到風景秀麗的海灘度假，但千鳥要因為宗介的缺席而悶悶不樂。原來Mithril的情報機關發現了九龍的行蹤，決定派出精鋭部隊實施暗殺，有豐富經驗的宗介被借調，駕駛着“強弩兵”前往他出生長大的中亞小國巴基斯坦。

同行的Mithril駕駛員高傲自大，在與敵人的初次交火中便被打的潰不成軍。

　　駕駛着強弩兵的宗介成功地抵擋住了九龍的攻擊，隊友們趁機強走了這夥恐怖份子小心保護着的貨車，結果發現車裏裝的居然是核彈。宗介等人帶着受傷的戰友艱難地躲避着敵人的追殺。宗介設計伏擊九龍，但他過去的戰友扎伊特如今與九龍在一起，他猜出了宗介的計謀，帶領九龍及恐怖份子出動大批部隊圍剿宗介一行人。

　　在扎伊特的攻擊下，宗介陷入苦戰。此時九龍突襲待機的其餘隊友，雖然他們拼命反抗，但在先進的武器面前無法抵擋全部被殺，其中女僱傭兵格雷連同AS一起被殘忍地釘在懸崖上。

宗介僥倖打倒了扎伊特趕回救援，與九龍發生正面激戰，雙方的λ系統全開碰撞，發生了巨大的爆炸。

　　學校舉行文化節，但宗介卻用上全部預算去建造一個安全門，令小要大為惱火，不過宗介卻忽然邀請她去南方“南方小島”度假，令她欣喜不已。

不過此時由於恐怖分子襲擊了費爾島並獲得大量化學武器，泰莎不得不修改計劃，讓宗介帶小要跳傘來到水下的丹努號，一起慶祝這艘潛艇下水一週年。

　　小要、梅麗莎和泰莎三人坐在由AS化學清洗池改造的浴缸裏，談起了過去梅麗莎和宗介及克魯茲最初相遇的情形。

　　泰莎告訴了小要一些關於“耳語者”的秘密，原來她自己也是一個“耳語者”。

很快“Mithril”發動了拯救費爾島上人質並摧毀化學武器的行動，為了對付蘇制AS“毒液”和頭號恐怖份子九龍，駕駛強弩兵的宗介被安排專門與“毒液”纏鬥。出乎眾人意料，一番激戰後九龍居然舉手投降。

　　九龍被帶進了丹努號，儘管加里寧相信他另有所謀，但並沒有想到丹努號內部已經被滲透。九龍和丹努號裏暗插的第五縱隊會合，突然襲擊了艦橋，將丹努號掌握在了自己手中。

　　九龍將泰莎當成人質，迫使艇員們就範，並改變了艇裏的電腦設置。為了制止他的瘋狂，泰莎幫助小要帶着機密鑰匙逃走，九龍用丹努號的潛射導彈攻擊了海面上的美軍巡洋艦“邦克山”號。

　　美軍潛艇向丹努號發射了魚雷，但九龍似乎想拖着全艦的人一起死。此時小要已經拿到了泰莎的鑰匙，她和宗介來到了丹努號的最機密地帶——原來這裏是丹努號的λ系統。小要和λ系統連接上後，泰莎通過她重新控制了丹努號，並讓丹努號衝上了海面。九龍逃到了機庫並啓動了“毒液”，與宗介的“強弩兵”展開一場惡戰。

　　經過一番死戰，宗介的強弩兵打倒了九龍的毒液，垂死掙扎的九龍忽然發力緊緊抱住了強努兵並開動了自爆裝置。此時控制着丹努號的小要用升降機將兩人送上了彈射甲板，在最後幾秒中，宗介得到了小要的指引，將九龍卡在彈射器上自己則綁住了甲板，巨大的衝力將九龍和“毒液”彈進了海中，隨後便是恐怖的爆炸。