內起源

側根開始發生時，中柱鞘相應部位的細胞恢復分生能力，並進行平周分裂，增加細胞層數，接着進行各個方向的分裂，突起形成側根原基，並分化出根冠和生長點。生長點不斷分裂、生長和分化，穿過皮層和表皮，伸入土壤中，成為側根。側根分化出的輸導組織與母根的輸導組織相連接而形成相互連通的輸導組織。

側根源於根內部的中柱鞘細胞，因此它的起源方式稱內起源。