三域系統

三域系統是由卡爾·烏斯(Carl Woese)在1977年提出的細胞生命形式分類，將原核生物分成了兩大類，起初稱為真細菌（Eubacteria）和古細菌（Archaebacteria）。Woese依據16S rRNA序列上的差別，認為這兩類生物和真核生物一起從一個具有原始遺傳機制的共同祖先分別演化而來，因此將三者各置為一個“域”（Domain），作為比“界”高一級的分類系統，並分別命名為細菌域（Bacteria）、古菌域（Archaea）和真核域（Eukarya）。

然而，rRNA樹有可能將演化太快的類羣放錯位置（比如微孢子蟲）。有人認為生物的根應該在真細菌之內，很多真細菌的類羣在古細菌之前分支出來，很晚古細菌和真核生物才彼此分開。